人类乳腺Xenium原位数据集
肿瘤领域多模态公开数据集,来源:10xgenomics.com。

基本信息
资源简介
人类乳腺Xenium原位数据集
【一句话概览】
可使用 Xenium Explorer Demo 桌面应用预览版,探索一份人类乳腺癌 FFPE 切片的空间原位数据集。该切片面积为 0.4 cm²,采用包含 280 个基因的 Xenium 人类乳腺基因表达 panel,并额外加入 33 个定制基因。相关标签涉及人类乳腺、FFPE、Xenium 原位、乳腺癌、基因表达、空间转录组学、H&E 染色、肿瘤异质性、三阳性细胞以及 ERBB2、ESR1、PGR(来源 10xgenomics.com)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Human Breast Tumors》。
【数据内容】
源站原始描述:Use Xenium Explorer Demo, a preview of the desktop app, to explore a Xenium In Situ dataset from a 0.4 cm² human breast cancer FFPE section using a 280-gene Xenium Human Breast Gene Expression Panel with 33 additional custom genes
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):使用Xenium Explorer Demo(桌面应用程序的预览版),通过包含280个基因的Xenium人类乳腺基因表达面板及33个额外定制基因,探索来自0.4平方厘米人类乳腺癌FFPE切片的Xenium原位数据集。
【主题与分类】
主题标签:Human breast、FFPE、Xenium In Situ、breast cancer、gene expression、spatial transcriptomics、H&E staining、tumor heterogeneity、triple-positive cells、ERBB2。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面:https://www.10xgenomics.com/products/xenium-in-situ/human-breast-dataset-explorer
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://www.10xgenomics.com/products/xenium-in-situ/human-breast-dataset-explorer
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集提供人类乳腺组织的空间转录组和H&E信息,页面展示了非典型导管增生和DCIS相关区域。
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