TARGET骨肉瘤项目数据集
肿瘤领域表格公开数据集，来源：portal.gdc.cancer.gov。
基本信息
资源简介
TARGET骨肉瘤项目数据集
【一句话概览】
TARGET-OS 项目（dbGaP 研究编号 phs000218）名称为 Osteosarcoma Program TARGET，受试者数 383。该项目包含受控访问数据，需通过 dbGaP 申请获取访问权限，具体参见受控数据获取说明。数据涵盖骨肉瘤相关生物样本、临床信息，以及组合核苷酸变异、拷贝数变异、DNA 甲基化、测序读段、简单核苷酸变异、体细胞结构变异、结构变异和转录组分析等内容（来源 portal.gdc.cancer.gov）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《TARGET-OS》。
【数据内容】
源站原始描述：The project has controlled access data which requires dbGaP Access. See instructions for Obtaining Access to Controlled Data. Project ID TARGET-OS dbGaP Study Accession phs000218 Project Name Osteosarcoma Program TARGET
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：该项目包含受控访问数据，需获得dbGaP访问权限。请参阅获取受控数据访问权限的说明。项目ID TARGET-OS，dbGaP研究登录号 phs000218，项目名称 骨肉瘤项目 TARGET。
【主题与分类】
主题标签：Osteosarcoma、TARGET、Biospecimen、Clinical、Combined Nucleotide Variation、Copy Number Variation、DNA Methylation、Sequencing Reads、Simple Nucleotide Variation、Somatic Structural Variation。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TARGET-OS
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TARGET-OS
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
TARGET骨肉瘤项目提供儿童骨肉瘤病例的基因组、转录组和临床注释数据，用于分子分型和预后研究。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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