急性髓系白血病(AML)中经功能验证的白血病干细胞(LSC)组分的RNA测序数据

62例AML患者样本按CD34/CD38分选出的111个组分的RNA测序数据,含LSC+/-功能注释,用于白血病层级组成与治疗反应研究。

NIAID Data Ecosystem
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基因组急性髓系白血病RNA测序
RNA sequencing of functionally validated LSC fractions in AML

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-16

资源简介

该数据集为急性髓系白血病(AML)患者样本的转录组测序数据。研究者对62例原发AML患者样本按CD34和CD38表面标记分选,获得111个细胞组分并进行RNA测序;每个组分依据异种移植实验中的植入能力进行白血病干细胞(LSC)活性的功能注释,其中包括70个LSC+(可植入)组分、40个LSC-(不可植入)组分,以及1个起始正常(非白血病)多系植入的组分。数据模态为转录组/基因表达(bulk RNA-seq),可用于解析白血病细胞层级组成(原始型、成熟型、GMP型、中间型四类)与功能、基因组及临床特征的关联,识别与化疗或靶向治疗反应相关的层级组成轴,并支持基于原始型与成熟型轴的7基因生物标志物对105种研究性药物应答的预测研究,服务于AML疾病生物学理解与精准医学。

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import pandas as pd, glob, os

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print("数据文件:", files)
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print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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