人类急性髓系白血病干细胞RNA测序数据
该数据集包含27个来自9名急性髓系白血病患者的白血病干细胞和原始细胞组分以及3个健康对照的RNA测序数据,属于基因表达模态,主要用于研究急性髓系白血病干细胞的分子特征、基因表达谱差异以及疾病发生机制,为白血病干细胞生物学、肿瘤异质性分析和潜在治疗靶点发现提供重要资源。

基本信息
资源简介
人类急性髓系白血病干细胞RNA测序数据
【一句话概览】
该数据集提供了人类急性髓系白血病(AML)干细胞(LSC)的RNA测序数据,涵盖来自9名AML患者的27个经功能验证的LSC与原始细胞组分,并包含3个来自年龄匹配对照的健康造血干细胞及祖细胞样本(来源 EGA)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《RNA-Sequencing data of Human Acute Myleloid Leukemia Stem Cells》。
【数据内容】
源站原始描述:RNA-Sequencing of 27 functionally validated LSC and blast fractions from 9 AML patients. Three healthy hematopoietic stem and progenitor cells from age-matched controls
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):对9名急性髓系白血病(AML)患者的27个经功能验证的白血病干细胞(LSC)和原始细胞组分进行了RNA测序。另对来自年龄匹配对照的3个健康造血干细胞和祖细胞进行了测序。
【主题与分类】
主题标签:None。
【获取与许可】
源站页面:https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001006112
下载信息
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数据集获取
源站:https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001006112
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含27个经过功能验证的白血病干细胞和原始细胞组分(来自9名急性髓系白血病患者)的RNA测序数据,以及3个来自年龄匹配对照的健康造血干细胞和祖细胞。数据通过RNA测序技术获取,可用于研究急性髓系白血病干细胞的特征、基因表达谱以及疾病机制。主要研究方向包括白血病干细胞生物学、肿瘤异质性、生物标志物发现和治疗靶点识别。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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