小肠神经内分泌肿瘤RNA测序数据集
该数据集包含七个小肠神经内分泌肿瘤样本的RNA测序数据,数据模态为基因表达序列,通过Illumina Nextseq 500平台生成,主要用于研究神经内分泌肿瘤的转录组特征、识别差异表达基因、探索分子机制,并为临床诊断和靶向治疗提供潜在的生物信息学依据。

基本信息
资源简介
小肠神经内分泌肿瘤RNA测序数据集
【一句话概览】
该数据集标题为“RNA-seq of small intestinal neuroendocrine tumors”,描述了对七例小肠神经内分泌肿瘤进行 RNA 测序,测序平台为 illumina Nextseq 500。源站未提供标签(来源 EGA)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《RNA-seq of small intestinal neuroendocrine tumors.》。
【数据内容】
源站原始描述:RNA-seq of seven small intestinal neuroendocrine tumors, sequenced with illumina Nextseq 500
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):七个小肠神经内分泌肿瘤的RNA-seq,使用illumina Nextseq 500进行测序。
【主题与分类】
主题标签:None。
【获取与许可】
源站页面:https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001004491
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001004491
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含七个小肠神经内分泌肿瘤样本的RNA测序数据,使用Illumina Nextseq 500平台进行测序。数据来源于欧洲基因组-表型组档案库(EGA),可用于研究神经内分泌肿瘤的基因表达谱、分子亚型、潜在生物标志物以及相关信号通路,为肿瘤生物学、诊断和治疗研究提供支持。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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