结直肠癌细胞分泌的细胞外囊泡长RNA测序分析数据集

该数据集包含结直肠癌细胞分泌的细胞外囊泡的长RNA测序数据,涉及编码RNA和长链非编码RNA等多种RNA模态,通过高通量测序技术获取原始FASTQ文件和分析结果,主要用于研究结直肠癌中细胞外囊泡的RNA分泌特征、肿瘤细胞间通信机制以及探索潜在的诊断或治疗生物标志物。

Mendeley Data
2024-06-25 更新
浏览 11
RNA测序结直肠癌

基本信息

创建/更新时间
2024-06-25

资源简介

该数据集是一个针对结直肠癌细胞分泌的细胞外囊泡(EVs)进行长RNA测序分析的研究数据集。数据集包含结直肠癌细胞释放的细胞外囊泡中编码RNA和长链非编码RNA(lncRNAs,长度>200nt)的测序数据,特别关注突变KRAS基因的结直肠癌细胞。数据内容包括原始FASTQ测序文件以及相关分析结果,展示了细胞外囊泡中特异性富集的非编码RNA(如反义转录本和假基因来源转录本)与细胞内RNA谱的差异。该数据集通过高通量测序技术构建,主要应用于研究结直肠癌的细胞外囊泡RNA分泌机制、肿瘤微环境通信以及潜在的生物标志物发现。

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https://data.mendeley.com/datasets/9pd453pm7k

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    • ModelScope: pip install modelscopemodelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个针对结直肠癌细胞分泌的细胞外囊泡(EVs)进行长RNA测序分析的研究数据集。数据集包含结直肠癌细胞释放的细胞外囊泡中编码RNA和长链非编码RNA(lncRNAs,长度>200nt)的测序数据,特别关注突变KRAS基因的结直肠癌细胞。数据内容包括原始FASTQ测序文件以及相关分析结果,展示了细胞外囊泡中特异性富集的非编码RNA(如反义转录本和假基因来源转录本)与细胞内RNA谱的差异。该数据集通过高通量测序技术构建,主要应用于研究结直肠癌的细胞外囊泡RNA分泌机制、肿瘤微环境通信以及潜在的生物标志物发现。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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