结直肠癌细胞分泌的细胞外囊泡长RNA测序分析数据集
该数据集包含结直肠癌细胞分泌的细胞外囊泡的长RNA测序数据，涉及编码RNA和长链非编码RNA等多种RNA模态，通过高通量测序技术获取原始FASTQ文件和分析结果，主要用于研究结直肠癌中细胞外囊泡的RNA分泌特征、肿瘤细胞间通信机制以及探索潜在的诊断或治疗生物标志物。
基本信息
资源简介
结直肠癌细胞分泌的细胞外囊泡长RNA测序分析数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Long RNA-Sequencing Analysis of Extracellular Vesicles secreted by colorectal cancer cells》。源站首次发布：2018-09-04。
【数据内容】
源站原始描述：Although much is known about extracellular miRNA, the identity, regulation, and functional roles of secreted coding and long noncoding RNAs (lncRNAs, >200nt) are largely unknown. We have previously shown that mutant KRAS colorectal cancer (CRC) cells release EVs containing distinct proteomes, miRNAs, and circular RNAs. Here, we comprehensively identify the broad and diverse classes of CRC extracellular long RNAs secreted in EVs and demonstrate differential export of specific RNAs. We show that d…
【数据结构与技术规格】
文件数 209 个，合计 76.74 MB。数据集 DOI：10.17632/9pd453pm7k.1。
【获取与许可】
源站页面：https://data.mendeley.com/datasets/9pd453pm7k
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://data.mendeley.com/datasets/9pd453pm7k
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个针对结直肠癌细胞分泌的细胞外囊泡（EVs）进行长RNA测序分析的研究数据集。数据集包含结直肠癌细胞释放的细胞外囊泡中编码RNA和长链非编码RNA（lncRNAs，长度>200nt）的测序数据，特别关注突变KRAS基因的结直肠癌细胞。数据内容包括原始FASTQ测序文件以及相关分析结果，展示了细胞外囊泡中特异性富集的非编码RNA（如反义转录本和假基因来源转录本）与细胞内RNA谱的差异。该数据集通过高通量测序技术构建，主要应用于研究结直肠癌的细胞外囊泡RNA分泌机制、肿瘤微环境通信以及潜在的生物标志物发现。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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