急性髓系白血病患者骨髓间充质基质细胞的成脂分化倾向及其对白血病细胞支持作用的研究数据集
该数据集包含急性髓系白血病患者与正常供体骨髓间充质基质细胞的转录组测序数据(RNA-Seq),属于基因表达模态。通过对比分析,揭示了AML-MSCs具有更强的成脂分化倾向,并能更好地支持白血病祖细胞存活,主要应用于白血病微环境机制、细胞分化调控及潜在治疗靶点的研究方向。

基本信息
资源简介
急性髓系白血病患者骨髓间充质基质细胞的成脂分化倾向及其对白血病细胞支持作用的研究数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Bone marrow mesenchymal stromal cells from acute myelogenous leukemia patients demonstrate adipogenic differentiation propensity with implications for leukemia cell support》。源站首次发布:2022-02-20。
【数据内容】
源站原始描述:Bone marrow mesenchymal stromal cells (MSCs) constitute one of the important components of the hematopoietic microenvironmental niche. There is in vitro evidence that marrow MSCs are able to support leukemia progenitor cell proliferation and survival and provide resistance to cytotoxic therapies. How MSCs from leukemia marrow differ from normal counterparts and how they are influenced by the presence of leukemia stem, and progenitor cells are still incompletely understood. In this work, we compa…
【主题与分类】
主题标签:人、间充质干细胞、转录组。
【获取与许可】
源站页面:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=141c35f5cda460dbf4101dd788c5057b
使用许可:openSource。
下载信息
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数据集获取
源站:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=141c35f5cda460dbf4101dd788c5057b
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集聚焦于急性髓系白血病(AML)患者骨髓中的间充质基质细胞(MSCs),并与正常供体(ND)的MSCs进行对比。数据内容主要包括通过RNA-Seq技术获得的转录组测序数据,以及相关的基因本体和通路分析结果。研究发现,AML来源的MSCs表现出更强的成脂分化潜能,并能够更好地支持白血病祖细胞的存活。数据集揭示了SOX9和EGR2等基因在AML-MSCs中的表达变化,及其对细胞功能和白血病微环境的影响。该数据集可用于研究白血病微环境中基质细胞的作用机制、细胞分化调控以及潜在的治疗靶点探索。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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