肌炎中组织驻留基质细胞启动维持慢性炎症
该数据集来自 cellxgene.cziscience.com,包含约96,000个细胞,通过单核RNA测序(GEXSCOPE技术)分析肌炎患者骨骼肌中的肌源性和非肌源性微环境

基本信息
资源简介
肌炎中组织驻留基质细胞启动维持慢性炎症
该数据集来自 cellxgene.cziscience.com,包含约96,000个细胞,通过单核RNA测序(GEXSCOPE技术)分析肌炎患者骨骼肌中的肌源性和非肌源性微环境。覆盖疾病包括antisynthetase syndrome、immune-mediated necrotizing myopathy、inclusion body myositis和正常样本,组织为肌肉器官,物种为人类。该图谱旨在研究基质细胞在肌炎谱系中的背景特异性表型,并证明慢性炎症启动基质区室以维持肌肉病理。可用于肌炎相关细胞分类、基质细胞异质性及慢性炎症机制研究(来源 cellxgene.cziscience.com)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们旨在创建炎症肌肉中肌源性和非肌源性微环境的图谱。我们的目标是分析肌炎谱系中的基质细胞,并研究其背景特异性表型。该研究包含约96,000个细胞,来自肌炎患者骨骼肌的单核RNA测序。物种为人类。通过该图谱,我们希望证明慢性炎症启动基质区室以维持肌肉病理。疾病:antisynthetase syndrome、immune-mediated necrotizing myopathy、inclusion body myositis、正常。组织:肌肉器官。检测:GEXSCOPE技术。单细胞数据集(CZ CELLxGENE)。
【主题与分类】
主题标签:antisynthetase syndrome、immune-mediated necrotizing myopathy、inclusion body myositis、normal。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://cellxgene.cziscience.com/collections/bec32fb0-9b52-423a-83c4-5e15053b84ad
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们旨在构建炎症肌肉中肌源性和非肌源性微环境的图谱。我们的目标是分析肌炎谱系中的基质细胞,并研究其特定情境下的表型。该研究包含约96,000个细胞,来源于肌炎患者骨骼肌的单核RNA测序。物种为人类。通过这一图谱,我们希望证明慢性炎症使基质区室准备好维持肌肉病理状态。疾病:抗合成酶综合征、免疫介导的坏死性肌病、包涵体肌炎、正常。组织:肌肉器官。检测方法:GEXSCOPE技术。单细胞数据集(CZ CELLxGENE)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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