GSE101719：Nr2f转录因子促进脊椎动物上颌身份

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE101719

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

颌骨在形态和功能上互补，但发育不对称，表现为下颌骨围绕一个显著的软骨模板形成，而上颌骨则不如此。这种骨骼组成差异如何被模式化尚不清楚。在此，我们鉴定出四个核受体2f基因——nr2f1a、nr2f1b、nr2f2和nr2f5——在斑马鱼上颌前体细胞中富集。Nr2f基因缺失导致上颌软骨扩展，使其类似于下颌软骨；而Nr2f5的异位表达则抑制下颌软骨形成。全基因组分析显示，Nr2f基因阻止了下颌相关基因表达向上颌区域的扩展。此外，Endothelin1信号对Nr2f表达的限制对下颌发育至关重要，因为降低Nr2f剂量可完全恢复edn1突变体的下颌发育。我们提出，Nr2f基因通过限制上颌早期软骨分化、保留更多前体细胞用于后续骨形成，从而驱动颌骨不对称发育。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。