唐氏综合征模型小鼠三倍体基因影响性别特异性骨骼缺陷的遗传分析

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源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Aacdeee171b52b88159f07cdefed9ded892559cb77557c1f5e9b4f0b8de18e5e6

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

唐氏综合征（DS）由人类21号染色体（Hsa21）三体引起，导致骨骼发育不全（骨密度低）和骨骼发育改变。DS小鼠模型重现了这些缺陷，包括长骨改变中的性别二态性。历史上，Ts65Dn小鼠凭借约100个三体同源基因，为DS相关骨骼缺陷的许多认识提供了依据，但由于该模型包含与Hsa21非同源基因的三体重复，其遗传保真度存在担忧。一种新的DS模型Ts66Yah从Ts65Dn中减去了非Hsa21同源的三体基因，但尚未对其长骨缺陷进行评估。比较这些模型之间的骨骼表型，可以确定非Hsa21同源三体基因的贡献，以及Ts66Yah小鼠作为DS相关骨骼缺陷模型是否具有相关性。

在评估了雄性和雌性Ts66Yah股骨在……时的个体密度测量、形态测量和力学变量后，将六周、九周和十六周龄的Ts66Yah股骨用封口膜包裹以保持水分，并使用SkyScan 1172 µCT系统（Bruker，Kontich，比利时）进行单次扫描，参数如下：60kV、167uA、885ms、10微米体素大小、Al 0.5mm滤片、0.7°旋转步长和两次帧平均。每个扫描时段使用两个羟基磷灰石体模（0.25和0.75g/cm3 CaHA）校准骨密度。P36小鼠的股骨用封口膜包裹并进行分组扫描（Kohler等，2021），使用SkyScan 1272 µCT系统（Bruker，Kontich，比利时），参数如下：70kV、142uA、1265ms、10微米体素大小、Al 0.5mm滤片、0.7°旋转步长和两次帧平均。每个扫描时段使用两个羟基磷灰石体模（0.3和1.25g/cm3 CaHA）校准骨密度。未对不同µCT系统的扫描结果进行非标准化比较。所有扫描均使用NRecon进行重建，参数如下……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。