角蛋白细胞中Tristetraprolin表达对皮肤癌发生的保护作用

该数据集包含通过化学诱导皮肤癌模型获得的实验数据,涉及基因表达、蛋白质相互作用和信号通路等多模态信息,主要研究RNA结合蛋白Tristetraprolin(TTP)在角质形成细胞中通过调控mRNA稳定性对皮肤肿瘤发生的保护作用,重点关注TTP对肿瘤相关炎症和EGFR等致癌通路的影响,为皮肤癌的分子机制和潜在治疗靶点提供研究基础。

Université Libre de BruxellesUniversité Libre de Bruxelles
干细胞与再生医学数据中心
2022-02-20 更新
浏览 7
皮肤癌基因调控

基本信息

创建/更新时间
2022-02-20

资源简介

该数据集聚焦于皮肤癌的发病机制,研究RNA结合蛋白Tristetraprolin(TTP,由Zfp36基因编码)在皮肤肿瘤发生中的调控作用。数据集包含通过化学诱导皮肤癌模型获得的实验数据,涉及TTP在角质形成细胞中的条件性过表达或敲除,以及其对肿瘤相关炎症和致癌通路(如EGFR信号通路)的影响。数据来源于小鼠模型实验,包括基因表达、蛋白质相互作用和信号通路分析。主要研究方向为TTP通过调控靶基因(如Areg)的mRNA稳定性,在皮肤癌早期发生中的保护机制,为癌症治疗提供潜在靶点。

原始链接

http://data.iscr.ac.cn/Article?id=3eec46a37eea786ba279e1226c287808

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数据说明

该数据集聚焦于皮肤癌的发病机制,研究RNA结合蛋白Tristetraprolin(TTP,由Zfp36基因编码)在皮肤肿瘤发生中的调控作用。数据集包含通过化学诱导皮肤癌模型获得的实验数据,涉及TTP在角质形成细胞中的条件性过表达或敲除,以及其对肿瘤相关炎症和致癌通路(如EGFR信号通路)的影响。数据来源于小鼠模型实验,包括基因表达、蛋白质相互作用和信号通路分析。主要研究方向为TTP通过调控靶基因(如Areg)的mRNA稳定性,在皮肤癌早期发生中的保护机制,为癌症治疗提供潜在靶点。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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