健康人跟腱单细胞图谱中跨微解剖区域的成纤维细胞特化

数据集获取

源站：https://cellxgene.cziscience.com/collections/a7e81820-297d-4086-8123-cc7dde64e495

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

肌腱是连接肌肉与骨骼的过渡性组织，使运动及精细运动控制得以实现。对于跟腱单元整体的细胞生物学，目前了解甚少，但这对于解读其微解剖学定义的功能区的正常功能及病理变化至关重要。我们构建了人类跟腱的空间分辨转录组图谱，对肌腱-骨连接处（附着点）、中段、肌腱-肌肉连接处及相邻肌肉进行了采样。鉴定出六种成纤维细胞亚型，具有不同的转录谱和空间分布，提示其在肌腱-肌肉单元中承担着特化的功能角色。两种主要成纤维细胞类型特异性地定位于肌腱中段实质及腱旁组织（围绕肌腱纤维的富含血管区域）；其他细胞群体包括神经周围成纤维细胞、肌腱-肌肉连接处特异性成纤维细胞、肌肉特异性成纤维细胞及衬里层成纤维细胞。这些发现表明，过渡性组织中的细胞多样性可能是其微解剖学特异性功能的基础。

该图谱为了解肌腱-肌肉单元的细胞功能提供了基础，并且对于与病变组织进行比较、识别跟腱自身免疫性和退行性病变的致病介质及治疗靶点至关重要。疾病：正常。组织：跟腱。检测方法：10x 3’ v3。单细胞数据集（CZ CELLxGENE）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。