特发性炎症性肌病中MicroRNA与mRNA表达谱分析的数据集附加文件3

主题标签:特发性炎症性肌病、MicroRNA、mRNA、表达谱、肌肉骨骼疾病、转录组。本站分类:肌肉骨骼疾病/其他。本数据集为肌肉骨骼疾病领域公开数据集,主题涵盖特发性炎症性肌病。

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基因组分类特发性炎症性肌病MicroRNAmRNA表达谱肌肉骨骼疾病转录组
Additional file 3 of MicroRNA and mRNA profiling in the idiopathic inflammatory myopathies

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

特发性炎症性肌病中MicroRNA与mRNA表达谱分析的数据集附加文件3

该数据集英文名为 Additional file 3 of MicroRNA and mRNA profiling in the idiopathic inflammatory myopathies,来源于 springernature.figshare.com,属于肌肉骨骼疾病 / 其他分类下的公开数据集。其主题围绕特发性炎症性肌病(idiopathic inflammatory myopathies)中的 MicroRNA 与 mRNA 表达谱研究,涉及转录组层面的分子 profiling 内容。数据集由 Parkes, Joanna E.、Thoma, Anastasia、Lightfoot, Adam P.、Day, Philip J.、Chinoy, Hector 与 Lamb, Janine A. 于 2020 年发布,DOI 为 10.6084/m9.figshare.12457157.v1。作为一项已发表研究的补充文件,它为关注特发性炎症性肌病分子机制的研究者提供了可公开获取的数据资源,主题标签涵盖特发性炎症性肌病、MicroRNA、mRNA、表达谱、肌肉骨骼疾病与转录组。

【数据集背景】

特发性炎症性肌病是一组以肌肉炎症和损伤为主要特征的异质性自身免疫性疾病,其发病机制涉及复杂的基因表达调控过程。MicroRNA 作为转录后调控的重要分子,与 mRNA 表达谱的联合分析有助于揭示疾病相关的调控网络。该数据集作为相关研究的补充材料发布,旨在为同行提供研究过程中产生的表达谱数据,支持结果复现与后续分析。源站描述中明确其为 Additional file 3,说明它是主研究论文的配套数据文件之一。

【数据内容】

该数据集的主题标签包括特发性炎症性肌病、MicroRNA、mRNA、表达谱、肌肉骨骼疾病与转录组,表明其内容涉及 MicroRNA 与 mRNA 两个层面的表达谱信息。数据集名称中“profiling”一词指向表达谱分析,因此可判断其内容与分子表达水平的系统检测相关。关于具体样本数量、检测平台、基因或 MicroRNA 条目数、数据文件的具体格式与字段结构,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源站为 springernature.figshare.com,由 Parkes, Joanna E. 等人于 2020 年发布,版本为 v1,DOI 为 10.6084/10.6084/m9.figshare.12457157.v1。该数据集作为研究论文的补充文件(Additional file 3)公开,属于 Figshare 平台上的开放科研数据。关于样本采集地点、受试者来源、伦理审批信息、实验平台与试剂等具体采集细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签,该数据集适用于特发性炎症性肌病相关的分子机制研究,例如 MicroRNA 与 mRNA 表达谱的联合分析、转录组层面的调控网络探索,以及肌肉骨骼疾病领域的生物信息学二次分析。它也可用于研究方法的教学演示或作为同类研究的对照参考。关于具体的适用分析流程或已验证的应用案例,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以公开数据集形式发布,可通过其 DOI 链接访问并下载。使用者可依据自身研究目的对表达谱数据进行再分析。关于数据文件的具体格式、是否需要特定软件处理、是否附带分析代码或说明文档,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为已发表研究的补充文件,其发布经过 Figshare 平台托管,具备可引用的 DOI。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应处理、样本量大小及统计效力等信息,源站未提供。使用者应注意补充文件通常仅覆盖研究的部分结果,完整信息需结合主论文理解。

【引用与许可】

引用该数据集时应遵循学术规范,标注作者 Parkes, Joanna E.、Thoma, Anastasia、Lightfoot, Adam P.、Day, Philip J.、Chinoy, Hector 与 Lamb, Janine A.,年份 2020,数据集名称及 DOI 10.6084/m9.figshare.12457157.v1。关于该数据集的具体许可协议类型与使用条款,源站未提供。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(Figshare)

源站:https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_3_of_MicroRNA_and_mRNA_profiling_in_the_idiopathic_inflammatory_myopathies/12457157

按页面 Download 按钮获取。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

Parkes, Joanna E.; Thoma, Anastasia; Lightfoot, Adam P.; Day, Philip J.; Chinoy, Hector; Lamb, Janine A. (2020). Additional file 3 of MicroRNA and mRNA profiling in the idiopathic inflammatory myopathies [Dataset]. http://doi.org/10.6084/m9.figshare.12457157.v1

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