SVCV感染通过稳定hif1α诱导斑马鱼缺氧反应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE260453

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

缺氧信号通路调控生物体的缺氧适应与耐受，并受多种机制调节。病毒感染会引发宿主产生多种病理生理反应。然而，病毒感染是否能够影响缺氧应答仍很大程度上未知。本研究发现，鲤春病毒血症病毒（SVCV）感染斑马鱼后引起的症状与斑马鱼在缺氧条件下的症状相似。进一步实验表明，SVCV感染激活了斑马鱼体内的缺氧信号通路。此外，SVCV感染导致细胞糖酵解和ROS水平升高。机制上，SVCV-G蛋白与hif1α-a/b相互作用并减弱其K48连接的多聚泛素化，从而导致其稳定性增强并随后增强靶基因表达。此外，使用HIF1α特异性抑制剂PX478处理可增强斑马鱼及斑马鱼细胞对SVCV感染的抗病毒能力。本研究揭示了鱼类中SVCV感染与缺氧信号通路之间的关系，并为减少水产养殖业中病毒性疾病的损害提供了策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。