来自：全球分布重叠的产黄青霉物种形成：亚历山大·弗莱明幸运真菌的群体遗传学

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源站：https://doi.org/10.5061/dryad.cg1jv

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数据说明

八十年前，亚历山大·弗莱明描述了污染其细菌培养物的一种真菌的抗生素效果，从而启动了抗菌革命。这种真菌后来被归为一种推测全球分布的无性种——产黄青霉。最近，该物种已被证明具有遗传多样性，并拥有交配型基因。在此，系统发育和群体遗传学分析表明，这种看似无处不在的真菌实际上由至少两个遗传上不同的物种组成，仅在生理学上检测到细微差异。我们在弗莱明工作过的圣玛丽医院及其周边收集的空气和灰尘样本中发现了这两个物种。对全基因组30个标记的基因分型显示，来自弗莱明实验室的保存真菌材料与目前培养物保藏中的衍生菌株几乎相同，并且与当前青霉素生产工业菌株的野生祖本菌株属于同一独特物种，而非模式种产黄青霉。

全球范围内对这两种最常见物种的样本研究发现，其交配型基因比例接近1：1，并显示出重组证据，且地理种群分化不明显。然而，尽管估计分化时间不足100万年，两种之间并未检测到杂交现象。生长研究表明，产黄青霉对其他常见物种具有显著的种间抑制作用，这表明尽管分布全球重叠，竞争可能促进了物种的维持。研究结果强调了即使在最知名的真菌类群中也存在未被充分认识到的多样性，以及尽管分布重叠，物种形成的潜力仍然存在。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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