蚊虫肠道细菌群落与发育关系数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.qs43p

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 6.85 GB。

数据说明

蚊虫是备受关注的昆虫，因为有几个物种可将致病病原体传播给人类和其他脊椎动物。我们此前报道，长期实验室培养的蚊虫需要其肠道内存在活细菌才能发育，但发育并不依赖于特定种类的细菌。在此，我们聚焦于三个不同但相互关联的研究领域，通过研究来自美国东南部的野外和实验室埃及伊蚊(Aedes aegypti)、白纹伊蚊(Aedes albopictus)和致倦库蚊(Culex quinquefasciatus)种群，以更好地理解细菌在蚊虫发育中的作用。细菌16S rRNA基因扩增子的序列分析显示，来自不同采集地点的幼虫其细菌群落组成存在显著差异，而来自同一地点的幼虫则具有相似性。尽管此前未知埃及伊蚊会被沃尔巴克氏体(Wolbachia)感染，结果还表明来自一个野外地点的埃及伊蚊携带双重感染。然而，无论采集地点或诸如沃尔巴克氏体感染等因素如何，每种蚊虫都需要其消化道内存在活细菌才能发育。

结果还发现了在使用抗生素消除幼虫体内细菌群落以研究其发育后果时存在的若干问题。总体而言，我们的结果表明，几种蚊子需要活菌才能发育。我们还假设，这些物种并不依赖特定的细菌，因为幼虫在其发育的水生栖息地中并不能可靠地遇到相同的细菌。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。