X连锁无丙种球蛋白血症中初始调节性T细胞亚群发生改变

该数据集提供了X连锁无丙种球蛋白血症患者及健康对照外周血中四种T细胞亚群的T细胞受体克隆集数据,包含基因测序生成的分子序列信息,主要用于研究原发性免疫缺陷病中T细胞受体库的异常变化,特别是初始调节性T细胞亚群的改变,为理解相关疾病的免疫机制提供重要数据基础。

Manto, Irina A.; Shagina, Irina A.; Merzlyak, Ekaterina M.; Khaitov, Musa R.; V. Britanova, Olga; S. Egorov, Evgeny; Kofiadi, Ilya A.; Kriukova, Valeriia V.; B. Staroverov, Dmitriy; Nakonechnaya, Tatiana O.; Latysheva, Elena A.; Kasatskaya, Sofya A.; Lupyr, Ksenia R.; Chudakov, Dmitriy M.; Shelyakin, Pavel V.; A. Lukyanov, SergeyManto, Irina A.; Shagina, Irina A.; Merzlyak, Ekaterina M.; Khaitov, Musa R.; V. Britanova, Olga; S. Egorov, Evgeny; Kofiadi, Ilya A.; Kriukova, Valeriia V.; B. Staroverov, Dmitriy; Nakonechnaya, Tatiana O.; Latysheva, Elena A.; Kasatskaya, Sofya A.; Lupyr, Ksenia R.; Chudakov, Dmitriy M.; Shelyakin, Pavel V.; A. Lukyanov, Sergey
Figshare
2021-08-08 更新
浏览 27
分类CD4CD8memorynaiveyoungoldXLAImmunology
Naïve Regulatory T Cell Subset Is Altered in X-Linked Agammaglobulinemia

基本信息

大小
0.429409663 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2021-08-08
版本
v1

资源简介

X连锁无丙种球蛋白血症中初始调节性T细胞亚群发生改变

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Naïve Regulatory T Cell Subset Is Altered in X-Linked Agammaglobulinemia》。源站首次发布:2021-08-08。

【数据内容】

源站原始描述:Clonosets from 4 cell subsets (CD4+ memory, CD4+ naive, CD8+ memory, CD8+ naive) sorted from blood of XLA and healthy (old and young) donors. Total RNA was isolated using the RNeasy mini kit (Qiagen) according to the manufacturer’s instructions. In all experiments described here, cDNA libraries were obtained using 5’-RACE with unique molecular identifiers (UMI) using Human TCR profiling kit (MiLaboratory LLC). Libraries were sequenced on Illumina NextSeq 500 using 300 cycle reagent kit, paired-e…

主表 O1_8M.txt 含 11 列、样本前 2000 行结构完整。

【数据结构与技术规格】

文件数 68 个,合计 429.41 MB。O1_8M.txt:text/plain,2.74 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.15128715.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Immunology not elsewhere classified。主题标签:CD4、CD8、memory、naive、young、old、XLA、Immunology。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。源站学科分类标注为 Immunology not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Na_ve_Regulatory_T_Cell_Subset_Is_Altered_in_X-Linked_Agammaglobulinemia/15128715

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Shelyakin, Pavel V.; Lupyr, Ksenia R.; S. Egorov, Evgeny; Kofiadi, Ilya A.; B. Staroverov, Dmitriy; Kasatskaya, Sofya A.; et al. (2021). Naïve Regulatory T Cell Subset Is Altered in X-Linked Agammaglobulinemia. figshare. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-30,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

源站:https://figshare.com/articles/dataset/Na_ve_Regulatory_T_Cell_Subset_Is_Altered_in_X-Linked_Agammaglobulinemia/15128715

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数据说明

该数据集包含来自X连锁无丙种球蛋白血症(XLA)患者以及健康老年和年轻供体的外周血样本中四种细胞亚群(CD4+记忆、CD4+初始、CD8+记忆、CD8+初始)的克隆集数据。数据通过流式细胞术分选细胞后,使用RNeasy mini试剂盒提取总RNA,并采用5’'-RACE结合独特分子标识符(UMI)技术构建cDNA文库,利用Human TCR profiling kit进行T细胞受体(TCR)分析。文库在Illumina NextSeq 500平台上进行双端150nt测序,最终通过MIGEC、MIXCR和VDJTOOLS工具从测序数据中推断出T细胞克隆型。该数据集主要用于研究XLA患者免疫系统中T细胞受体库的变化,特别是初始调节性T细胞亚群的异常,为理解原发性免疫缺陷病的免疫病理机制提供数据支持。

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