Cronobacter turicensis z3032与斑马鱼幼体宿主-病原体双转录组学数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE236051

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

克罗诺杆菌（Cronobacter，简称C.）是一种重要的新发机会性食源性病原体，是新生儿菌血症和脑膜炎患者死亡的重要原因。关于克罗诺杆菌介导的脑膜炎的病理生物学知识，在很大程度上是通过体外模型来探索的。为在体内探索针对引起新生儿败血症/脑膜炎的分离株C. turicensis z3032的先天免疫反应，本研究采用斑马鱼幼鱼（Danio rerio）作为感染模型。在用z3032建立斑马鱼幼鱼感染后，进行了宿主-病原体双RNA测序，以同时分析病原体和斑马鱼宿主头部区域的RNA表达谱。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。