X连锁慢性肉芽肿病造血干祖细胞碱基编辑修复突变数据集
本数据集来自clinicaltrials.gov,聚焦X连锁慢性肉芽肿病(X-CGD)的碱基编辑治疗研究。该研究为开放标签1/2期试验,评估单次输注碱基编辑(BE)自体造血干祖细胞(HSPCs)的安全性与有效性,通过修复CYBB错义突变(如CYBB c.676C>T)恢复NADPH氧化酶活性

基本信息
资源简介
X连锁慢性肉芽肿病造血干祖细胞碱基编辑修复突变数据集
本数据集来自clinicaltrials.gov,聚焦X连锁慢性肉芽肿病(X-CGD)的碱基编辑治疗研究。该研究为开放标签1/2期试验,评估单次输注碱基编辑(BE)自体造血干祖细胞(HSPCs)的安全性与有效性,通过修复CYBB错义突变(如CYBB c.676C>T)恢复NADPH氧化酶活性。数据覆盖受试者单采收集CD34+ HSPCs、突变特异性BE系统开发验证及治疗阶段。可用于评估碱基编辑效率、HSPCs植入与分化功能,以及X-CGD基因修复疗法的安全性和有效性预测(来源 clinicaltrials.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):条件:慢性肉芽肿病(CGD)、X连锁慢性肉芽肿病。研究描述:开放标签、1/2期试验,旨在确定单次输注碱基编辑(BE)自体造血干祖细胞(HSPCs)治疗X连锁慢性肉芽肿病(X-CGD)的安全性和有效性。进行碱基编辑以修复CYBB错义基因突变(例如,CYBB c.676C>T)。研究假设是:1)碱基编辑能够有效修复HSPCs中的基因突变;2)BE HSPCs能够植入并分化为功能性吞噬细胞,且烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)氧化酶活性恢复。在初始开发阶段,每位研究参与者将接受单采以收集CD34+ HSPC,用于开发和验证突变特异性BE系统。在治疗阶段,参与者将
【主题与分类】
主题标签:Chronic Granulomatous Disease (CGD)、X-Linked Chronic Granulomatous Disease。本站分类:免疫系统疾病/慢性肉芽肿病。
【获取与许可】
源站页面:https://clinicaltrials.gov/study/NCT06325709
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- OpenDataLab:
数据说明
疾病:慢性肉芽肿病(CGD)、X连锁慢性肉芽肿病。研究描述:开放标签、1/2期试验,旨在确定单次输注碱基编辑(BE)自体造血干/祖细胞(HSPCs)治疗X连锁慢性肉芽肿病(X-CGD)的安全性和有效性。进行碱基编辑以修复CYBB错义基因突变(例如,CYBB c.676C>T)。研究假设为:1)碱基编辑能够有效修复HSPCs中的基因突变;2)BE HSPCs能够植入并分化为功能性吞噬细胞,且烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)氧化酶活性得以恢复。在初始开发阶段,每位研究参与者将接受单采术以采集CD34+ HSPCs,用于开发和完善针对特定突变的BE系统。在治疗阶段,参与者在接受Campath(阿仑单抗)和布司他芬预处理(总剂量12 mg/kg,目标总AUC为65,000 ng/mL x hr)后,将接受一次性输注BE自体HSPC(研究产品)。西罗莫司将于第-1天开始使用,并可能持续给药约3-6个月。
参与者将在第3、6、12、18和24个月接受随访评估,此后每年一次,直至治疗后5年。关键研究评估包括不良事件(AE)评估、靶基因(CYBB,编码gp91^phox)所制造功能性蛋白的血液实验室检测,以及脱氧核糖核酸(DNA)测序,以确定基因修复率和脱靶突变率。本方案下的最终研究随访将在5年时进行,但根据另一项NIH方案进行的长期随访将继续每年一次,直至治疗后15年。目标:主要目标:* 评估BE自体CD34+细胞的安全性。* 评估BE自体CD34+细胞的疗效。次要目标:-评估:* 碱基编辑的效率(靶核苷酸转化百分比)。* BE HSPCs的植入能力。* 恢复
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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