iPSC来源内皮-造血转变的发育调控
该数据集来自 cellxgene.cziscience.com,包含人 iPSC 衍生胚胎体在造血分化过程中的单细胞转录组数据

基本信息
资源简介
iPSC来源内皮-造血转变的发育调控
该数据集来自 cellxgene.cziscience.com,包含人 iPSC 衍生胚胎体在造血分化过程中的单细胞转录组数据。数据涵盖 sci-RNA-seq 第 7 至 21 天,以及第 8 天 10X 3' sc-RNA-seq,并与已发表的人胚胎 10X 数据(Zeng et al. 2019、Crosse et al. 2020、Calvanese et al. 2022)整合。共提供三个可视化视图,涉及 HSC 非依赖与 HSC 依赖阶段。疾病标注为 normal,可用于研究内皮-造血转变的发育调控(来源 cellxgene.cziscience.com)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):对人 iPSC 衍生胚胎体在造血分化第 7 天至第 21 天进行单细胞组合索引 RNA-seq (sci-RNA-seq)。将分化第 8 天的人 iPSC 衍生胚胎体的 10X 3’ sc-RNA-seq 与已发表的人胚胎 10X 3’ sc-RNA-seq 数据集整合,涵盖 HSC 非依赖的 Carnegie Stage (CS) 10-13(Zeng et al. 2019)和 HSC 依赖的 CS 14-17(Crosse et al. 2020, Calvanese et al. 2022)时间点。共有 3 个可视化:(1) 造血分化期间第 7-21 天 iPSC 衍生胚胎体的 sci-RNA-seq,(2) 仅造血分化期间第 8 天 iPSC 衍生胚胎体的 10X 数据,以及 (3) 造血分化期间第 8 天 iPSC 衍生胚胎体的 10X 数据与来自 Zeng et al. 2019、Crosse et al. 2020 和 Calvanese et al. 2022 的人胚胎 10X 数据整合。疾病:normal。组织:do
【主题与分类】
主题标签:normal。本站分类:血液与淋巴系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://cellxgene.cziscience.com/collections/4a2c25af-558a-45fc-bc9a-54ec44a1d63f
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数据集获取
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
人iPSC来源的拟胚体在造血分化第7天至第21天的单细胞组合索引RNA测序(sci-RNA-seq)。人iPSC来源的拟胚体在分化第8天的10X 3’ sc-RNA-seq,与已发表的人胚胎10X 3’ sc-RNA-seq数据集整合,涵盖非HSC依赖期、卡内基分期(CS)10-13(Zeng等,2019),以及HSC依赖期、CS 14-17(Crosse等,2020;Calvanese等,2022)的时间点。共有3个可视化:(1)sci-RNA-seq第7-21天iPSC来源拟胚体在造血分化过程中,(2)仅10X第8天iPSC来源拟胚体在造血分化过程中的数据,以及(3)10X第8天iPSC来源拟胚体在造血分化过程中与来自Zeng等,2019、Crosse等,2020和Calvanese等,2022的人胚胎10X数据整合。疾病:正常。组织:背侧侧板区域、胚胎、拟胚体。检测方法:10x 3’ v2、10x 3’ v3、sci-RNA-seq3。单细胞数据集(CZ CELLxGENE)。
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