基本信息

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创建/更新时间

2026-10-12

资源简介

多中心卡斯尔曼病双胞胎及未患病同胞12样本单细胞转录组数据

GSE241096 是一个聚焦于血液与淋巴系统疾病中卡斯尔曼病的单细胞转录组数据集，收录于 NCBI Gene Expression Omnibus（GEO），并通过 usebiotransfer.org 的 GEO Finder 工具提供访问入口。该数据集的核心样本来自患有多中心卡斯尔曼病的双胞胎以及一名未受影响的同胞，共包含 12 份样本的单细胞转录组数据。其设计特点在于利用双胞胎与同胞对照的结构，为研究多中心卡斯尔曼病在单细胞层面的转录特征提供了数据基础。数据集在分类上归属于血液与淋巴系统疾病 / 卡斯尔曼病，主题标签涵盖血液与淋巴系统疾病、卡斯尔曼病、单细胞转录组、GEO、双胞胎以及同胞对照，适合关注该疾病分子机制与单细胞水平表达谱的研究者参考使用。

【数据集背景】

卡斯尔曼病是一类较为罕见的淋巴增殖性疾病，其中多中心卡斯尔曼病可累及多个淋巴结区域，临床表现和病理机制较为复杂。GSE241096 的建立与这一疾病背景相关，其样本设计围绕双胞胎患者与未受影响同胞展开，旨在通过单细胞转录组数据刻画不同个体之间的细胞层面差异。该数据集被归入血液与淋巴系统疾病 / 卡斯尔曼病这一分类，说明其应用方向与血液、淋巴系统相关的疾病研究密切相关。数据集的英文名称明确指向“患有多中心卡斯尔曼病的双胞胎与一名未受影响同胞的 12 份样本的单细胞转录组数据”，这构成了该数据集最基本的研究情境。

【数据内容】

该数据集包含 12 份样本的单细胞转录组数据，样本来源为患有多中心卡斯尔曼病的双胞胎以及一名未受影响的同胞。数据类型为单细胞转录组数据，主题标签中亦包含“单细胞转录组”。从样本结构看，数据同时覆盖患病双胞胎与未患病同胞，为在单细胞分辨率下比较不同个体状态提供了材料。除上述信息外，关于具体细胞类型、测序平台、基因数量、细胞数量等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI Gene Expression Omnibus，编号为 GSE241096。其来源站记录为 usebiotransfer.org，具体访问路径为 https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE241096/。源站描述将其标注为 NCBI Gene Expression Omnibus 中的数据集，并给出了完整英文名称。除来源站与 GEO 编号外，关于样本采集地点、时间、伦理审批信息以及具体实验流程，源站未提供。

【适用场景】

基于其疾病分类与样本设计，该数据集可用于血液与淋巴系统疾病特别是卡斯尔曼病相关的单细胞转录组研究。双胞胎与未受影响同胞的样本结构，使其适合用于探索患病个体与未患病个体在单细胞表达层面的差异。主题标签中的“同胞对照”也提示该数据可用于对照比较类分析。此外，该数据集可作为单细胞转录组数据分析流程的输入材料，用于细胞聚类、细胞类型注释、差异表达分析等通用分析场景。但具体分析目标与结论需结合研究者自身问题，源站未提供预设的分析结论或应用案例。

【使用方法】

该数据集可通过 usebiotransfer.org 的 GEO Finder 工具入口访问，其来源指向 NCBI Gene Expression Omnibus 的 GSE241096 记录。使用者通常可依据 GEO 数据集的通用使用方式获取数据并进行后续分析。关于该数据集的具体下载格式、文件组织方式、是否需要额外处理步骤以及配套代码，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为单细胞转录组数据，样本量为 12 份，来源为双胞胎患者与一名未受影响同胞。其设计上的特点在于双胞胎与同胞对照结构，但关于数据质量指标、测序深度、细胞存活率、批次效应、技术重复等信息，源站未提供。此外，该数据集是否经过标准化处理、是否存在已知的技术偏差，源站亦未提供。使用者在使用时应结合自身分析需求评估数据适用性。

【引用与许可】

该数据集的引用信息为：NCBI Gene Expression Omnibus, GSE241096: Single cell transcriptomic data of 12 samples collected from twins with Multicentric Castleman Disease and an unaffected sibling [Dataset]. https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE241096/。关于该数据集的许可条款、使用限制以及是否需要额外授权，源站未提供。

原始链接

https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE241096

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE241096

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

NCBI Gene Expression Omnibus, GSE241096: Single cell transcriptomic data of 12 samples collected from twins with Multicentric Castleman Disease and an unaffected sibling [Dataset]. https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE241096/

数据加载示例（图像类）

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import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别