“解析前庭神经鞘瘤中氧化应激作用”转录组数据集与分析代码

该数据集是一个转录组学数据集,包含前庭神经鞘瘤与对照神经样本的标准化基因表达矩阵(文本模态)以及相关的R分析代码,数据来源于公共GEO数据库并经过批次效应校正,主要用于研究氧化应激在前庭神经鞘瘤中的分子机制,支持差异表达、通路富集、免疫浸润等生物信息学分析,以探索潜在的治疗靶点。

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2025-09-20 更新
浏览 50
vestibular schwannomaoxidative stressbioinformaticsGEOimmune infiltrationhub genes
Transcriptomic datasets and analysis code for "Deciphering oxidative stress contributions in vestibular schwannoma"

基本信息

大小
0.19 GB
许可
cc-by-4.0
创建/更新时间
2025-09-20
版本
1.0

资源简介

“解析前庭神经鞘瘤中氧化应激作用”转录组数据集与分析代码

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Transcriptomic datasets and analysis code for "Deciphering oxidative stress contributions in vestibular schwannoma"》。源站首次发布:2025-09-20。

【数据内容】

源站原始描述:This dataset contains the normalized gene-expression matrix (62 vestibular schwannoma vs. 18 control nerve samples) produced after batch-effect removal of GEO series GSE54934 and GSE56597, together with all R scripts used for differential expression, GO/KEGG, GSEA, PPI-hub gene, immune-infiltration (ssGSEA) and ROC analyses described in the manuscript "Deciphering oxidative stress contributions in vestibular schwannoma: a bioinformatics approach to novel therapeutic pathways". The fifteen oxidat…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 191.85 MB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.17163233。

【主题与分类】

主题标签:vestibular schwannoma、oxidative stress、bioinformatics、GEO、immune infiltration、hub genes。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/17163233

使用许可:cc-by-4.0。

规范引用:PLOS ONE

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数据集获取(Zenodo 公开直链)

源站:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.17163233

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数据说明

该数据集是一个转录组学数据集,旨在支持前庭神经鞘瘤中氧化应激作用的研究。它包含经过批次效应校正后的标准化基因表达矩阵,涵盖62个前庭神经鞘瘤样本和18个对照神经样本,数据来源于GEO系列GSE54934和GSE56597。数据集还提供了用于差异表达分析、GO/KEGG富集分析、GSEA、PPI枢纽基因识别、免疫浸润(ssGSEA)及ROC分析的所有R脚本,以及研究中确定的15个氧化应激相关差异表达基因(OSRDEGs)和9个枢纽基因(如CDKN2A、CYBB等)。数据以纯文本和RDS格式提供,便于复现论文中的图表结果,主要应用于神经肿瘤学、生物信息学分析和氧化应激机制探索。

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