前庭神经鞘瘤氧化应激贡献解析转录组数据集与分析代码
该数据集包含前庭神经鞘瘤与对照神经样本的标准化基因表达矩阵（转录组数据）以及用于生物信息学分析的完整R脚本，数据模态为基因表达谱和程序代码，主要用于研究前庭神经鞘瘤中氧化应激的分子机制，通过差异表达分析、通路富集分析和免疫浸润分析等方法，识别关键基因并探索潜在治疗靶点，支持神经肿瘤学领域的机制研究和生物信息学方法验证。
基本信息
资源简介
前庭神经鞘瘤氧化应激贡献解析转录组数据集与分析代码
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Transcriptomic datasets and analysis code for "Deciphering oxidative stress contributions in vestibular schwannoma"》。源站首次发布：2025-10-10。
【数据内容】
源站原始描述：This dataset contains the normalized gene-expression matrix (62 vestibular schwannoma vs. 18 control nerve samples) produced after batch-effect removal of GEO series GSE54934 and GSE56597, together with all R scripts used for differential expression, GO/KEGG, GSEA, PPI-hub gene, immune-infiltration (ssGSEA) and ROC analyses described in the manuscript "Deciphering oxidative stress contributions in vestibular schwannoma: a bioinformatics approach to novel therapeutic pathways". The fifteen oxidat…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 67.48 KB。数据集 DOI：10.5281/zenodo.17312999。
【主题与分类】
主题标签：vestibular schwannoma、oxidative stress、bioinformatics、GEO、immune infiltration、hub genes。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/17312999
使用许可：cc-by-4.0。
规范引用：PLOS ONE
下载信息
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.17312999
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数据说明
该数据集包含用于研究前庭神经鞘瘤中氧化应激作用的转录组数据及相关分析代码。数据集整合了GEO数据库中的GSE54934和GSE56597两个序列，经过批次效应校正后得到标准化的基因表达矩阵（包含62个前庭神经鞘瘤样本和18个对照神经样本）。同时提供完整的R脚本，用于差异表达分析、GO/KEGG富集分析、GSEA分析、PPI枢纽基因识别、免疫浸润分析（ssGSEA）和ROC分析。特别包含15个氧化应激相关差异表达基因和9个枢纽基因（CDKN2A、CYBB、EGFR、IL6、ADIPOQ、HMOX1、NAMPT、PTGS2、TXN）。数据以纯文本和RDS格式提供，支持研究结果的完全复现，主要应用于神经肿瘤学、氧化应激机制研究和生物信息学方法开发。
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