俄勒冈健康与科学大学 Beat AML 队列数据集
Beat AML 队列是由俄勒冈健康与科学大学(OHSU)主导构建的大型白血病精准医疗研究数据集。该项目收集了近千例初治和复发急性髓系白血病患者的骨髓和外周血样本,进行了深度的全外显子测序和RNA转录组测序,并针对数百种小分子抑制剂进行了体外药物敏感性测试(药敏筛选),是连接AML分子特征与靶向药物反应机制的核心数据库。

基本信息
资源简介
俄勒冈健康与科学大学 Beat AML 队列数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Acute Myeloid Leukemia (OHSU, Cancer Cell 2022)》。
【数据内容】
源站原始描述:Whole-exome and transcriptomic sequencing of 942 acute myeloid leukemia samples (with 500 matched normals) from the Beat AML program
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:pmid:35868306。
【主题与分类】
主题标签:aml。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.cbioportal.org/study/summary?id=aml_ohsu_2022
规范引用:Bottomly et al. Cancer Cell 2022
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.cbioportal.org/study/summary?id=aml_ohsu_2022
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
提供了超千例AML样本的基因突变、RNA表达及体外离体药物敏感性筛选结果,是研究白血病药敏响应的关键数据集。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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