cBioPortal:急性髓系白血病(TCGA,PanCancer Atlas)

数据主题标签为 aml,本站分类为肿瘤 / 其他。可用于急性髓系白血病相关的肿瘤分类、基因组变异分析及 PanCancer 比较研究等任务(来源 cBioPortal)

cbioportal
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基因组分类aml
cBioPortal: Acute Myeloid Leukemia (TCGA, PanCancer Atlas)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

cBioPortal:急性髓系白血病(TCGA,PanCancer Atlas)

cBioPortal 收录的急性髓系白血病(Acute Myeloid Leukemia,AML)数据集,来源于 TCGA PanCancer Atlas 项目,英文全称为 cBioPortal: Acute Myeloid Leukemia (TCGA, PanCancer Atlas)。该数据集在站内归入“肿瘤 / 其他”分类,主题标签为 aml,可通过 cbioportal.org 访问。作为 TCGA PanCancer 系列的一部分,它聚焦于急性髓系白血病这一血液系统恶性肿瘤,为研究者提供与肿瘤分类、基因组变异分析以及 PanCancer 层面比较研究相关的数据资源。该数据集关联多项已发表研究,并提供了相应的文献标识,便于用户在分析时追溯原始研究背景与数据出处。

【数据集背景】

急性髓系白血病是起源于髓系造血干祖细胞的恶性克隆性疾病,在肿瘤基因组学研究中具有重要地位。TCGA PanCancer Atlas 项目旨在对多种癌症类型进行统一、跨癌种的整合分析,急性髓系白血病作为其中的一个癌种被纳入。该数据集即是在这一框架下形成的 AML 数据集合,其源站标题为“Acute Myeloid Leukemia (TCGA, PanCancer Atlas)”,源站描述指出这是急性髓系白血病 TCGA PanCancer 数据,并给出了原始数据与相关出版物的链接位置。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 aml,本站分类为“肿瘤 / 其他”。依据其短描述,数据可用于急性髓系白血病相关的肿瘤分类、基因组变异分析及 PanCancer 比较研究等任务。数据集与多篇出版物相关联,其 DOI 字段以 pmid 形式列出多个文献编号,包括 29625048、29596782、29622463、29617662、29625055、29625050、29617662、32214244、296 等。除上述信息外,关于具体样本数量、变异类型、组学层次等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 cbioportal.org,即 cBioPortal 平台。源站描述中说明,原始数据可在其给出的链接处获取,相关出版物亦可在指定链接处查阅。数据归属于 TCGA PanCancer Atlas 项目下的急性髓系白血病部分。关于具体的采集流程、样本处理方式、测序平台与数据处理管线等信息,源站未提供。

【适用场景】

根据该数据集的短描述,其适用场景包括:急性髓系白血病相关的肿瘤分类研究、基因组变异分析,以及 PanCancer 层面的比较研究。由于该数据集属于 TCGA PanCancer Atlas 框架,适合需要在跨癌种背景下考察 AML 特征的研究者使用。关于其他具体应用方向,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 cbioportal.org 访问。源站描述中提供了原始数据与相关出版物的链接位置,用户可据此获取数据并查阅对应文献。关于数据下载格式、分析工具、接口调用方式等具体操作细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集关联多项出版物,并提供了相应的文献标识,可供用户追溯其研究背景。关于数据质量评估、覆盖度、样本代表性、已知偏差或使用限制等信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集关联的文献标识包括 pmid:29625048、29596782、29622463、29617662、29625055、29625050、29617662、32214244、296 等。源站描述中给出了出版物的查阅链接。关于具体的引用格式要求、许可协议类型及使用条款等信息,源站未提供。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=laml_tcga_pan_can_atlas_2018

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Acute Myeloid Leukemia TCGA PanCancer data. The original data is here . The publications are here .

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