TARGET急性淋巴细胞白血病II期临床与组学数据
TARGET-ALL-P2是儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)领域的重要多模态数据集。该项目系统收集了大量儿童白血病患者的临床资料、基因组变异测序和基因表达谱数据，旨在通过深入解析ALL的分子机制，发现和验证能够改善患儿预后的新型靶向治疗方案。
基本信息
资源简介
TARGET急性淋巴细胞白血病II期临床与组学数据
【一句话概览】
TARGET-ALL-P2 项目（dbGaP 研究编号 phs000218）聚焦急性淋巴细胞白血病（ALL）II 期，疾病类型为淋巴系白血病，原发部位为造血与网状内皮系统，隶属 TARGET 计划。该项目含受控访问数据，需经 dbGaP 授权方可获取。受试者数为 1587。数据涵盖生物样本、临床信息、拷贝数变异、测序读段、简单核苷酸变异、体细胞结构变异、结构变异及转录组分析等内容（来源 portal.gdc.cancer.gov）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《TARGET-ALL-P2》。
【数据内容】
源站原始描述：The project has controlled access data which requires dbGaP Access. See instructions for Obtaining Access to Controlled Data. Project ID TARGET-ALL-P2 dbGaP Study Accession phs000218 Project Name Acute Lymphoblastic Leukemia - Phase II Disease Type Lymphoid Leukemias Primary Site Hematopoietic and reticuloendothelial systems Program TARGET
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：该项目包含受控访问数据，需通过dbGaP获取访问权限。有关获取受控数据访问权限的说明，请参见指南。项目ID TARGET-ALL-P2，dbGaP研究登录号 phs000218，项目名称 急性淋巴细胞白血病 - II期，疾病类型 淋巴系白血病，原发部位 造血和网状内皮系统，项目计划 TARGET。
【主题与分类】
主题标签：Acute Lymphoblastic Leukemia、Lymphoid Leukemias、Hematopoietic and reticuloendothelial sy、TARGET、Biospecimen、Clinical、Copy Number Variation、Sequencing Reads、Simple Nucleotide Variation、Somatic Structural Variation。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面：https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TARGET-ALL-P2
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TARGET-ALL-P2
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 1500.00 GB。
数据说明
TARGET项目的ALL子集，包含数百名患儿的基因组、转录组数据及临床病理信息，致力于儿童ALL靶向治疗研究。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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