视网膜测序数据

该数据集包含胚胎发育第12周和第14周的视网膜组织单细胞测序数据,通过10x Genomics建库和Illumina平台测序获得,数据模态为基因表达谱。它主要用于研究胚胎期视网膜细胞的异质性、基因表达模式及分化轨迹,为视网膜发育生物学、视网膜母细胞瘤等疾病机制探索以及再生医学研究提供关键的分子水平资源。

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2023-11-07 更新
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单细胞测序胚胎发育

基本信息

创建/更新时间
2023-11-07

资源简介

该数据集为胚胎发育期视网膜组织的单细胞测序数据,采集自胚胎发育第12周和第14周的视网膜组织样本。数据获取过程包括:将组织剪碎后,使用木瓜蛋白酶、胶原酶IV和DNase1消化成单细胞悬液,经流式分选获得高活性视网膜单细胞,利用10x Genomics技术进行扩增建库,构建单细胞文库,并在Illumina平台上进行双端150bp测序。数据集主要应用于研究胚胎发育过程中视网膜细胞的异质性、基因表达动态及细胞分化轨迹,为视网膜发育生物学、疾病机制(如视网膜母细胞瘤)及再生医学研究提供重要资源。

原始链接

https://www.braindatacenter.cn/datacenter/web/#/dataSet/details?id=1721803920945160194

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集为胚胎发育期视网膜组织的单细胞测序数据,采集自胚胎发育第12周和第14周的视网膜组织样本。数据获取过程包括:将组织剪碎后,使用木瓜蛋白酶、胶原酶IV和DNase1消化成单细胞悬液,经流式分选获得高活性视网膜单细胞,利用10x Genomics技术进行扩增建库,构建单细胞文库,并在Illumina平台上进行双端150bp测序。数据集主要应用于研究胚胎发育过程中视网膜细胞的异质性、基因表达动态及细胞分化轨迹,为视网膜发育生物学、疾病机制(如视网膜母细胞瘤)及再生医学研究提供重要资源。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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