视网膜测序数据
该数据集包含胚胎发育第12周和第14周的视网膜组织单细胞测序数据,通过10x Genomics建库和Illumina平台测序获得,数据模态为基因表达谱。它主要用于研究胚胎期视网膜细胞的异质性、基因表达模式及分化轨迹,为视网膜发育生物学、视网膜母细胞瘤等疾病机制探索以及再生医学研究提供关键的分子水平资源。
基本信息
资源简介
该数据集为胚胎发育期视网膜组织的单细胞测序数据,采集自胚胎发育第12周和第14周的视网膜组织样本。数据获取过程包括:将组织剪碎后,使用木瓜蛋白酶、胶原酶IV和DNase1消化成单细胞悬液,经流式分选获得高活性视网膜单细胞,利用10x Genomics技术进行扩增建库,构建单细胞文库,并在Illumina平台上进行双端150bp测序。数据集主要应用于研究胚胎发育过程中视网膜细胞的异质性、基因表达动态及细胞分化轨迹,为视网膜发育生物学、疾病机制(如视网膜母细胞瘤)及再生医学研究提供重要资源。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后,才能进行数据下载,注册有对应要求,或者需要收费。
暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载,应该可以免费公开下载。
暂未开放有偿下载
Tips: 该数据集 Qianfanghub 可以协助提供有偿下载服务,注意,服务不针对数据相关产权,只是技术服务费。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放千方医数集,医疗数据集部分,是为社区服务的公开医疗数据集搜索引擎,并不存储或者下载原始的任何数据。 如果您有其他医疗数据需求,可以和客服联系,或者下工单。我们有强大的三甲医疗机构帮助您提供个性化的医疗数据定制、采集、标注服务。
使用方式
数据集获取
源站:https://www.braindatacenter.cn/datacenter/web/#/dataSet/details?id=1721803920945160194
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集为胚胎发育期视网膜组织的单细胞测序数据,采集自胚胎发育第12周和第14周的视网膜组织样本。数据获取过程包括:将组织剪碎后,使用木瓜蛋白酶、胶原酶IV和DNase1消化成单细胞悬液,经流式分选获得高活性视网膜单细胞,利用10x Genomics技术进行扩增建库,构建单细胞文库,并在Illumina平台上进行双端150bp测序。数据集主要应用于研究胚胎发育过程中视网膜细胞的异质性、基因表达动态及细胞分化轨迹,为视网膜发育生物学、疾病机制(如视网膜母细胞瘤)及再生医学研究提供重要资源。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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