视网膜测序数据
该数据集包含胚胎发育第12周和第14周的视网膜组织单细胞测序数据，通过10x Genomics建库和Illumina平台测序获得，数据模态为基因表达谱。它主要用于研究胚胎期视网膜细胞的异质性、基因表达模式及分化轨迹，为视网膜发育生物学、视网膜母细胞瘤等疾病机制探索以及再生医学研究提供关键的分子水平资源。
基本信息
资源简介
视网膜测序数据
【一句话概览】
取胚胎发育第12周和第14周的视网膜组织，剪碎后用木瓜蛋白酶、IV型胶原酶和DNase1消化为单细胞悬液，终止消化反应并流式分选，获得活性良好的视网膜单细胞。采用10x genomics对单细胞悬液进行扩增和建库，得到单细胞文库。文库质检合格后送测序公司，使用Illumina平台测序，测序长度为150 bp双端（来源 braindatacenter.cn）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Retina sequencing data》。
【数据内容】
源站原始描述：Obtain retinal tissue from the 12th and 14th weeks of embryonic development, cut the tissue into small pieces, digest it into a single cell suspension with papain, collagenase IV and DNase1, terminate the digestion reaction and perform flow sorting to obtain For retinal single cells with good activity, 10x genomics is used to amplify the single cell suspension and build a library to obtain a single cell library. After the library passes the quality inspection, it is sent to a sequencing company…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：获取胚胎发育第12周和第14周的视网膜组织，将组织切成小块，用木瓜蛋白酶、IV型胶原酶和DNase1消化成单细胞悬液，终止消化反应并进行流式分选，以获得活性良好的视网膜单细胞，采用10x genomics对单细胞悬液进行扩增并构建文库，获得单细胞文库。文库质检合格后，送至测序公司使用Illumina平台进行测序，测序长度为150 bp双端。
【主题与分类】
主题标签：Human retina、cell fate、single cell、10x genomics、RNA sequencing。
【获取与许可】
源站页面：https://www.braindatacenter.cn/datacenter/web/#/dataSet/details?id=1721803920945160194
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://www.braindatacenter.cn/datacenter/web/#/dataSet/details?id=1721803920945160194
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集为胚胎发育期视网膜组织的单细胞测序数据，采集自胚胎发育第12周和第14周的视网膜组织样本。数据获取过程包括：将组织剪碎后，使用木瓜蛋白酶、胶原酶IV和DNase1消化成单细胞悬液，经流式分选获得高活性视网膜单细胞，利用10x Genomics技术进行扩增建库，构建单细胞文库，并在Illumina平台上进行双端150bp测序。数据集主要应用于研究胚胎发育过程中视网膜细胞的异质性、基因表达动态及细胞分化轨迹，为视网膜发育生物学、疾病机制（如视网膜母细胞瘤）及再生医学研究提供重要资源。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
