人类常染色体隐性遗传视网膜色素变性(arRP)玻璃体蛋白质组学分析数据集
该数据集包含通过液相色谱-串联质谱技术获取的人类常染色体隐性遗传视网膜色素变性患者玻璃体样本的蛋白质组学数据,涵盖患者与对照组的蛋白质表达谱,主要用于研究视网膜色素变性的分子病理机制、PDE6基因突变对蛋白质组的影响,以及探索该疾病的潜在生物标志物和治疗靶点。

基本信息
资源简介
人类常染色体隐性遗传视网膜色素变性(arRP)玻璃体蛋白质组学分析数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Proteomic analysis of human autosomal recessive retinitis pigmentosa (arRP) vitreous》。源站首次发布:2019-09-04。
【数据内容】
源站原始描述:Mutations in PDE6 contribute to a significant fraction of retinitis pigmentosa (RP) cases (7-9%; OMIM: 180071). Vitreous biopsies were collected from two autosomal recessive RP (arRP) patients with PDE6A mutations undergoing epiretinal membrane removal. Epiretinal membrane (ERM) vitreous samples from two patients without RP were used as comparative controls. Vitreous samples were analyzed using shotgun liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) to determine proteomic content
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个,合计 108.47 KB。数据集 DOI:10.17632/x9mkhv743y.1。
【获取与许可】
源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/x9mkhv743y
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://data.mendeley.com/datasets/x9mkhv743y
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是针对人类常染色体隐性遗传视网膜色素变性(arRP)患者的玻璃体蛋白质组学分析数据。数据集包含来自两名携带PDE6A基因突变的arRP患者在进行视网膜前膜切除术时采集的玻璃体活检样本,以及两名非RP患者的视网膜前膜玻璃体样本作为对照。所有样本均通过鸟枪法液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)技术进行蛋白质组学分析,以确定其蛋白质组成。该数据集主要用于研究视网膜色素变性的分子机制,特别是PDE6基因突变对玻璃体蛋白质组的影响,为视网膜退行性疾病的生物标志物发现和病理机制研究提供重要资源。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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