ACO/RPE65嵌合体晶体结构

该数据集提供了ACO/RPE65嵌合体蛋白质的晶体结构数据,属于结构生物学模态,通过X射线衍射实验获得2.5Å分辨率的三维分子坐标,包含氯离子和铁(II)离子的结合位点信息,主要用于研究RPE65基因突变导致显性视网膜色素变性的分子机制,为疾病病理研究和潜在治疗靶点发现提供结构基础。

Protein Data Bank Japan
2023-10-04 更新
浏览 36
视网膜色素变性蛋白质晶体结构
Crystal structure of an ACO/RPE65 chimera

基本信息

创建/更新时间
2023-10-04

资源简介

ACO/RPE65嵌合体晶体结构

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Crystal structure of an ACO/RPE65 chimera》。

【数据内容】

源站原始描述:non-heme iron, chimera, 7-bladed propeller, OXIDOREDUCTASE

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.1093/hmg/ddy128。

【主题与分类】

主题标签:OXIDOREDUCTASE。

【获取与许可】

源站页面:https://www.rcsb.org/structure/6C7K

规范引用:Insights into the pathogenesis of dominant retinitis pigmentosa associated with a D477G mutation in RPE65. (2018) Hum.Mol.Genet

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源站:https://pdbj.org/mine/summary/6c7k

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个蛋白质晶体结构数据集,包含ACO/RPE65嵌合体的三维结构信息。数据来源于X射线衍射实验(分辨率2.5Å),记录了蛋白质分子中氯离子和铁(II)离子的结合位点。该结构通过PDBj(Protein Data Bank Japan)平台发布,主要用于研究RPE65基因D477G突变与显性视网膜色素变性的发病机制,为理解该遗传性眼病的分子基础提供结构生物学依据。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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