间变性淋巴瘤激酶催化域晶体结构

该数据集包含通过X射线衍射解析获得的间变性淋巴瘤激酶催化域的蛋白质晶体结构数据,涵盖ALK受体、ADP配体及甘油分子等结构信息,主要用于研究激酶催化机制、药物靶点设计以及间变性大细胞淋巴瘤等疾病的分子病理学与治疗开发。

Protein Data Bank Japan
2023-09-06 更新
浏览 43
蛋白质晶体结构ALK激酶
Crystal Structure of the Anaplastic Lymphoma Kinase Catalytic Domain

基本信息

创建/更新时间
2023-09-06

资源简介

间变性淋巴瘤激酶催化域晶体结构

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Crystal Structure of the Anaplastic Lymphoma Kinase Catalytic Domain》。

【数据内容】

源站原始描述:kinase catalytic domain, ATP-binding, Glycoprotein, Kinase, Membrane, Nucleotide-binding, Phosphoprotein, Proto-oncogene, Receptor, Transmembrane, Tyrosine-protein kinase, TRANSFERASE

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.1042/BJ20100609。

【主题与分类】

主题标签:TRANSFERASE。

【获取与许可】

源站页面:https://www.rcsb.org/structure/3LCT

规范引用:Crystal structure of the ALK (anaplastic lymphoma kinase) catalytic domain. (2010) Biochem.J

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源站:https://pdbj.org/mine/summary/3lct

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集提供了间变性淋巴瘤激酶(ALK)催化域的晶体结构数据,通过X射线衍射方法在2.1埃分辨率下解析获得。数据包含ALK酪氨酸激酶受体结构、配体ADENOSINE-5’'-DIPHOSPHATE以及GLYCEROL分子信息。该结构源自实验测定并公开于Protein Data Bank Japan,主要用于研究ALK激酶的催化机制、药物靶点识别以及间变性大细胞淋巴瘤等癌症的病理机制与治疗策略开发。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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