光学离焦相反符号下基因表达揭示视觉引导眼生长的双向机制
该数据集是一个基于普通狨猴模型的视网膜基因表达谱数据集，包含在近视性离焦和远视性离焦不同光学刺激条件下，视网膜转录组的测序数据。数据模态为基因组学数据（基因表达矩阵），主要应用于研究视觉引导的眼球生长调控机制、近视的分子发病机理，并探索与人类近视相关的潜在基因靶点和信号通路，为理解近视发展和寻找干预策略提供分子层面的证据。
基本信息
资源简介
光学离焦相反符号下基因表达揭示视觉引导眼生长的双向机制
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Gene expression in response to optical defocus of opposite signs reveals bidirectional mechanism of visually guided eye growth》。配套论文《Gene expression in response to optical defocus of opposite signs reveals bidirectional mechanism of visually guided eye growth》发表于 PLOS Biology（2018），DOI：10.1371/journal.pbio.2006021。源站首次发布：2018-10-09。
【数据内容】
源站原始描述：Myopia (nearsightedness) is the most common eye disorder, which is rapidly becoming one of the leading causes of vision loss in several parts of the world because of a recent sharp increase in prevalence. Nearwork, which produces hyperopic optical defocus on the retina, has been implicated as one of the environmental risk factors causing myopia in humans. Experimental studies have shown that hyperopic defocus imposed by negative power lenses placed in front of the eye accelerates eye growth and…
【数据结构与技术规格】
文件数 34 个，合计 30.37 MB。pbio.2006021.s001.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，16.88 KB。pbio.2006021.s002.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，25.63 KB。pbio.2006021.s003.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，15.01 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pbio.2006021。
【主题与分类】
源站学科分类：Medicine、Microbiology、Genetics、Molecular Biology、Neuroscience、Physiology。主题标签：hyperopic defocus、eye growth、29 genes differentially、QTL、eye growth Myopia、marmoset retina、myopia、pathway。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Microbiology、Genetics、Molecular Biology、Neuroscience、Physiology。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Gene_expression_in_response_to_optical_defocus_of_opposite_signs_reveals_bidirectional_mechanism_of_visually_guided_eye_growth/7183064
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：V. Tkatchenko, Tatiana; Troilo, David; Benavente-Perez, Alexandra; V. Tkatchenko, Andrei (2018). Gene expression in response to optical defocus of opposite signs reveals bidirectional mechanism of visually guided eye growth. PLOS Biology. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-30，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集聚焦于近视（近视眼）的分子机制研究，通过比较普通狨猴在经历10天或5周不同符号（近视性离焦与远视性离焦）光学离焦刺激后视网膜转录组的变化。数据集包含视网膜基因表达谱数据，揭示了视网膜能够区分不同符号的光学离焦信号，并激活或抑制不同的信号通路。研究发现，在狨猴视网膜中差异表达的29个基因位于人类近视数量性状基因座（QTLs）内，表明这些基因可能与人类近视的发病机制存在功能重叠。该数据集来源于实验研究，通过RNA测序技术构建，主要应用于视觉发育、近视发病机制、分子信号通路及潜在治疗靶点的探索。
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