289种表型流行率数据集
该数据集是一个整合了OMIM、ClinVar、Orphanet和GTR等多个权威数据库的基因-表型关联分析数据集，主要包含与遗传性代谢疾病相关的228个明确基因及其对应的表型流行率、染色体分布、致病性变异负荷和遗传模式等多模态信息，旨在通过构建基于证据的诊断面板（如关注不足面板和初始筛查面板）来提升遗传性代谢疾病的临床诊断准确性和效率，支持精准医疗和早期干预。
基本信息
资源简介
该数据集聚焦于遗传性代谢疾病（IMDs）的基因-表型关联分析，旨在将大规模基因组数据转化为临床可操作的诊断工具。数据集基于OMIM、ClinVar、Orphanet和遗传检测登记库（GTR）中的权威数据构建，系统性地梳理了372个OMIM条目，从中确定了228个与代谢疾病明确相关的基因（GAMD）。数据内容涵盖基因的染色体分布、致病性变异负荷、表型聚类模式（尤其在氨基酸代谢疾病中），以及遗传模式（以常染色体隐性遗传为主）。通过整合变异致病性、表型流行率和诊断测试可及性，数据集支持构建了两个基于证据的诊断面板：一个为'关注不足面板'，用于突出检测不足但临床相关且与高流行率IMDs相关的基因；另一个为'初始筛查面板'，优先选择致病性变异比例高、检测可及性强且临床相关性显著的基因，为一线诊断提供高效工具。该数据集的主要研究方向是提升遗传性代谢疾病的诊断准确性、支持早期干预，并促进疾病管理的公平性。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
源站：https://figshare.com/articles/dataset/Prevalence_of_the_289_phenotypes_/30012936
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数据说明
该数据集聚焦于遗传性代谢疾病（IMDs）的基因-表型关联分析，旨在将大规模基因组数据转化为临床可操作的诊断工具。数据集基于OMIM、ClinVar、Orphanet和遗传检测登记库（GTR）中的权威数据构建，系统性地梳理了372个OMIM条目，从中确定了228个与代谢疾病明确相关的基因（GAMD）。数据内容涵盖基因的染色体分布、致病性变异负荷、表型聚类模式（尤其在氨基酸代谢疾病中），以及遗传模式（以常染色体隐性遗传为主）。通过整合变异致病性、表型流行率和诊断测试可及性，数据集支持构建了两个基于证据的诊断面板：一个为’‘关注不足面板’‘，用于突出检测不足但临床相关且与高流行率IMDs相关的基因；另一个为’‘初始筛查面板’'，优先选择致病性变异比例高、检测可及性强且临床相关性显著的基因，为一线诊断提供高效工具。该数据集的主要研究方向是提升遗传性代谢疾病的诊断准确性、支持早期干预，并促进疾病管理的公平性。
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