289种表型患病率数据集
该数据集是一个整合了OMIM、ClinVar、Orphanet和GTR等多个权威数据库的遗传性代谢疾病基因-表型关联数据集,包含228个明确相关基因的染色体分布、致病性变异负荷、表型聚类及遗传模式等多模态信息,主要用于构建循证诊断面板以提升遗传代谢疾病的精准诊断效率、支持早期干预策略并改善临床诊断公平性,为基因组数据向临床实践转化提供可扩展框架。
https://figshare.com/articles/dataset/Prevalence_of_the_289_phenotypes_/30012936
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资源简介
该数据集聚焦于遗传性代谢疾病(IMDs)的基因-表型关联研究,通过整合OMIM、ClinVar、Orphanet和遗传检测注册库(GTR)等权威数据库的标准化数据,系统性地构建了包含228个明确与代谢疾病相关基因(GAMD)的关联信息。数据集详细记录了这些基因的染色体分布、致病性变异负荷、表型聚类特征(尤其在氨基酸代谢障碍中表现显著)以及以常染色体隐性遗传为主的遗传模式。研究进一步基于变异致病性、表型患病率和诊断测试可及性,设计了两套循证诊断面板:一是针对检测不足但临床相关基因的'漏报面板',旨在提升对高患病率IMDs的诊断覆盖;二是整合高致病性变异比例、广泛测试可及性和强临床相关性的'初筛面板',为一线诊断提供高效工具。该数据集主要应用于遗传代谢疾病的精准诊断、早期干预策略制定以及临床诊断公平性提升,为大规模基因组信息向临床实践转化提供了可扩展的框架。
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