人类视网膜单细胞转录组图谱识别与年龄相关性黄斑变性相关的细胞类型
该数据集来自 cellxgene.cziscience.com,主题标签为 normal,属于眼及附器疾病 / 其他分类

基本信息
资源简介
人类视网膜单细胞转录组图谱识别与年龄相关性黄斑变性相关的细胞类型
该数据集来自 cellxgene.cziscience.com,主题标签为 normal,属于眼及附器疾病 / 其他分类。数据基于两个独立平台对人类视网膜进行大规模并行单细胞 RNA 测序(scRNA-seq),报告了首个单细胞人类视网膜转录组图谱。通过多分辨率网络分析识别出所有主要视网膜细胞类型及其基因表达特征,并观察到 macroglia 内部的异质性。基于 GWAS 的富集分析进一步将 glia、血管细胞和视锥光感受器与年龄相关性黄斑变性(AMD)风险相关联,可用于研究视网膜细胞类型与 AMD 的关联(来源 cellxgene.cziscience.com)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):全基因组关联研究(GWAS)已鉴定出与年龄相关性黄斑变性(AMD)相关的遗传变异,AMD 是老年人失明的主要原因之一。然而,鉴于该疾病的遗传复杂性,识别与 AMD 相关的细胞类型一直具有挑战性。在此,我们使用两个独立平台对人类视网膜进行大规模并行单细胞 RNA 测序(scRNA-seq),并报告了首个单细胞人类视网膜转录组图谱。使用基于多分辨率网络的分析,我们识别出所有主要视网膜细胞类型及其相应的基因表达特征。在 macroglia 内部观察到异质性,表明人类视网膜胶质细胞比先前认为的更加多样。最后,基于 GWAS 的富集分析识别出 glia、血管细胞和视锥光感受器与风险相关
【主题与分类】
主题标签:normal。本站分类:眼及附器疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://cellxgene.cziscience.com/collections/1a486c4c-c115-4721-8c9f-f9f096e10857
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://cellxgene.cziscience.com/collections/1a486c4c-c115-4721-8c9f-f9f096e10857
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
全基因组关联研究(GWAS)已识别出与年龄相关性黄斑变性(AMD)相关的遗传变异,AMD是老年人失明的主要原因之一。然而,鉴于该疾病的遗传复杂性,识别与AMD相关的细胞类型一直是一项挑战。在此,我们使用两个独立平台对人类视网膜进行了大规模并行单细胞RNA测序(scRNA-seq),并报告了首个人类视网膜单细胞转录组图谱。通过基于多分辨率网络的分析,我们识别了所有主要的视网膜细胞类型及其相应的基因表达特征。在大胶质细胞中观察到了异质性,表明人类视网膜胶质细胞的多样性比之前认为的更为丰富。最后,基于GWAS的富集分析发现,胶质细胞、血管细胞和视锥光感受器与AMD风险相关。这些数据提供了对人类视网膜的详细分析,并展示了scRNA-seq如何为参与复杂炎症性遗传疾病的细胞类型提供见解。疾病:正常。组织:黄斑、视网膜周边区域。检测方法:10x 3’ v3。
Single-cell dataset (CZ CELLxGENE).
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




