bbs1斑马鱼光感受器外段LFQ蛋白质组学数据集
主题标签:眼病、巴德特-别德尔综合征、斑马鱼、光感受器外段、蛋白质组学、LFQ。本站分类:眼病/巴德特-别德尔综合征。本数据集为眼病领域公开数据集,主题涵盖眼病。

基本信息
资源简介
bbs1斑马鱼光感受器外段LFQ蛋白质组学数据集
LFQ-proteomic on bbs1 zebrafish photoreceptor outer segments 是一个公开的蛋白质组学数据集,主题聚焦于眼病领域中的巴德特-别德尔综合征(Bardet-Biedl syndrome,BBS)。该数据集以斑马鱼为研究对象,针对其光感受器外段(photoreceptor outer segments)开展无标记定量(LFQ)蛋白质组学分析,核心关联基因为 bbs1。数据集由 Markus Masek 于 2022 年发布,来源站为 ebi.ac.uk,属于 PRIDE 归档项目 PXD026646。本站将其归类于眼病 / 巴德特-别德尔综合征方向,主题标签涵盖眼病、巴德特-别德尔综合征、斑马鱼、光感受器外段、蛋白质组学与 LFQ,可供相关领域研究者检索与使用。
【数据集背景】
巴德特-别德尔综合征是一种与眼病相关的疾病,光感受器外段是其研究中的重要结构。斑马鱼作为模式生物,在眼病与光感受器相关研究中具有应用价值。该数据集围绕 bbs1 相关的斑马鱼光感受器外段展开,采用无标记定量蛋白质组学方法,旨在从蛋白质层面呈现该结构的相关信息。数据集由 Markus Masek 于 2022 年发布,来源站为 ebi.ac.uk,属于 PRIDE 归档项目 PXD026646。本站分类为眼病 / 巴德特-别德尔综合征,主题标签包括眼病、巴德特-别德尔综合征、斑马鱼、光感受器外段、蛋白质组学、LFQ。
【数据内容】
该数据集为 LFQ 蛋白质组学数据,研究对象为 bbs1 斑马鱼光感受器外段。其主题标签涵盖眼病、巴德特-别德尔综合征、斑马鱼、光感受器外段、蛋白质组学与 LFQ。本站将其归类于眼病 / 巴德特-别德尔综合征。关于具体的蛋白鉴定数量、定量结果、样本分组、重复数、差异表达蛋白列表等详细内容,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,源站描述为:Markus Masek (2022). LFQ-proteomic on bbs1 zebrafish photoreceptor outer segments [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD026646。数据集由 Markus Masek 于 2022 年发布,属于 PRIDE 归档项目 PXD026646。关于具体的实验流程、样本制备方法、质谱平台、色谱条件、采集参数等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于眼病领域,尤其是巴德特-别德尔综合征相关研究。其主题涵盖斑马鱼、光感受器外段、蛋白质组学与 LFQ,可用于与光感受器外段蛋白质组相关的分析场景。本站分类为眼病 / 巴德特-别德尔综合征。关于该数据集在具体研究中的适用性验证、推荐分析流程或特定应用案例,源站未提供。
【使用方法】
该数据集为公开数据集,来源站为 ebi.ac.uk,属于 PRIDE 归档项目 PXD026646。使用者可通过源站链接访问该数据集。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析软件、参数设置及处理步骤,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为公开数据集,来源站为 ebi.ac.uk,属于 PRIDE 归档项目 PXD026646,由 Markus Masek 于 2022 年发布。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应、技术重复一致性、定量准确性等质量相关信息,源站未提供。关于该数据集在样本量、覆盖度、分辨率等方面的限制,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用信息为:Markus Masek (2022). LFQ-proteomic on bbs1 zebrafish photoreceptor outer segments [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD026646。关于该数据集的许可条款、使用限制及再分发条件,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD026646
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Markus Masek (2022). LFQ-proteomic on bbs1 zebrafish photoreceptor outer segments [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD026646
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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