肝细胞HCF-1功能缺失小鼠模型中非酒精性脂肪性肝炎的快速再现 [RNA-seq]
该数据集是基于RNA-seq技术的小鼠肝细胞HCF-1基因敲除模型转录组数据，通过比较雄性和雌性敲除小鼠的肝脏表型，模拟了非酒精性脂肪肝向非酒精性脂肪性肝炎的疾病进展过程，主要用于研究HCF-1在肝脏代谢、线粒体功能和基因表达调控中的作用，为非酒精性脂肪性肝病的分子机制和潜在治疗靶点提供数据支持。
![Rapid recapitulation of non-alcoholic steatohepatitis upon loss of HCF-1 function in mouse hepatocytes [RNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/6153.jpg)
基本信息
资源简介
肝细胞HCF-1功能缺失小鼠模型中非酒精性脂肪性肝炎的快速再现 [RNA-seq]
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Rapid recapitulation of non-alcoholic steatohepatitis upon loss of HCF-1 function in mouse hepatocytes [RNA-seq]》。源站首次发布：2022-02-20。
【数据内容】
源站原始描述：Background and Aims: Host-cell factor 1 (HCF-1), encoded by the ubiquitously expressed X linked gene Hcfc1, is an epigenetic co-regulator important for mouse development and cell proliferation, including during liver regeneration. Here, we examine the role of HCF-1 in adult tissue physiology using, as model, the resting mouse liver. Methods: We used a hepatocyte-specific inducible Hcfc1 knock-out allele (called Hcfc1hepKO), to induce HCF-1 loss in hepatocytes of hemizygous Hcfc1 hepKO/Y males by…
【主题与分类】
主题标签：小鼠、肝、转录组。
【获取与许可】
源站页面：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=7bd408554d49ee0f6d50cec02d2aa41c
使用许可：openSource。
规范引用：PMID: 30559308, 31040203
下载信息
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源站：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=7bd408554d49ee0f6d50cec02d2aa41c
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个基于RNA测序（RNA-seq）的公开小鼠模型数据，旨在研究宿主细胞因子1（HCF-1）在肝脏生理和疾病中的作用。数据集包含在肝细胞特异性诱导Hcfc1基因敲除（Hcfc1hepKO）小鼠模型中获取的转录组数据，通过比较雄性和雌性敲除小鼠的肝脏表型，模拟了非酒精性脂肪肝（NAFL）向非酒精性脂肪性肝炎（NASH）的疾病进展过程。数据来源于干细胞与再生医学数据中心，通过基因工程和RNA-seq技术构建。主要研究方向包括HCF-1在肝脏代谢、线粒体功能和基因表达调控中的作用，以及其在非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）发病机制中的角色，为研究NASH的分子机制和潜在治疗靶点提供模型和数据支持。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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![小鼠肝细胞中HCF-1功能缺失后快速重现非酒精性脂肪性肝炎[ChIP-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/6160.jpg)
