来自健康和不可逆损伤的非酒精性脂肪性肝炎患者肝脏的类器官的转录组表征
该数据集包含从健康个体和终末期非酒精性脂肪性肝炎（NASH）患者肝脏中提取并培养的胆管类器官的转录组数据，数据模态为基因表达谱。其主要用途在于通过比较NASH与健康类器官的分子特征，揭示NASH相关的炎症、代谢及纤维化通路异常，为研究人类NASH的疾病机制、药物筛选及个体化医疗提供实验模型和基因组学依据。
基本信息
资源简介
来自健康和不可逆损伤的非酒精性脂肪性肝炎患者肝脏的类器官的转录组表征
【数据集背景】
源站首次发布：2023-02-10。
【数据内容】
源站原始描述：Background and Aims: Nonalcoholic steatohepatitis (NASH) will soon become the leading cause of liver transplantation in the US and is also associated with increased COVID-19 mortality. Currently, there are no FDA approved drugs available that slow NASH progression or address NASH liver involvement in COVID-19. Since animal models cannot fully recapitulate human NASH, we hypothesized that stem cells isolated directly from end-stage NASH patient liver may address current knowledge gaps in human NA…
【主题与分类】
主题标签：非酒精性脂肪性肝炎、NASH、人、肝脏、hepatic organoids、NASH explant liver、transcriptomic。
【获取与许可】
源站页面：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=92fb3244386948329f537fb281475eae
使用许可：licenseAgreement。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集聚焦于非酒精性脂肪性肝炎（NASH），这是一种缺乏有效治疗药物、可能成为美国肝移植主要原因的肝脏疾病。数据集包含从终末期NASH患者不可逆损伤肝脏以及健康肝脏中分离、培养并分化的双潜能胆管类器官的转录组数据。通过RNA测序技术，研究人员系统比较了NASH与健康来源类器官的基因表达差异，发现NASH类器官中炎症反应、细胞色素P450相关通路以及肝纤维化和肿瘤标志物显著上调，且上调程度具有患者特异性。该数据为研究人类NASH的病理机制、药物反应及个体化治疗提供了重要的体外模型和分子基础。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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