小鼠肝细胞中HCF-1功能缺失后快速重现非酒精性脂肪性肝炎[ChIP-seq]
该数据集是一个基于ChIP-seq技术的基因表达调控数据集，包含小鼠肝细胞中HCF-1蛋白结合的基因组位点信息及其缺失对基因表达的影响，数据模态为基因序列和表达谱；主要应用于研究非酒精性脂肪性肝炎（NASH）的疾病模型、HCF-1在肝脏生理中的功能机制，以及线粒体相关基因的调控网络，为理解NAFLD进展和开发治疗策略提供分子层面的依据。
![Rapid recapitulation of non-alcoholic steatohepatitis upon loss of HCF-1 function in mouse hepatocytes [ChIP-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/6160.jpg)
基本信息
资源简介
小鼠肝细胞中HCF-1功能缺失后快速重现非酒精性脂肪性肝炎[ChIP-seq]
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Rapid recapitulation of non-alcoholic steatohepatitis upon loss of HCF-1 function in mouse hepatocytes [ChIP-seq]》。源站首次发布：2022-02-20。
【数据内容】
源站原始描述：Background and Aims: Host-cell factor 1 (HCF-1), encoded by the ubiquitously expressed X linked gene Hcfc1, is an epigenetic co-regulator important for mouse development and cell proliferation, including during liver regeneration. Here, we examine the role of HCF-1 in adult tissue physiology using, as model, the resting mouse liver. Methods: We used a hepatocyte-specific inducible Hcfc1 knock-out allele (called Hcfc1hepKO), to induce HCF-1 loss in hepatocytes of hemizygous Hcfc1 hepKO/Y males by…
【主题与分类】
主题标签：小鼠、肝、基因组。
【获取与许可】
源站页面：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=32f93e79b4a41f1c003ef155197d7b87
使用许可：openSource。
规范引用：PMID: 30559308, 31040203
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个ChIP-seq数据集，旨在研究宿主细胞因子1（HCF-1）在成年小鼠肝脏生理中的作用。通过使用肝细胞特异性诱导性Hcfc1敲除等位基因（Hcfc1hepKO），在雄性小鼠中诱导HCF-1缺失，模拟了非酒精性脂肪肝（NAFL）向非酒精性脂肪性肝炎（NASH）的疾病进展。数据集包含了HCF-1在静息肝脏中结合的转录起始位点信息，以及HCF-1缺失对基因表达的影响，特别是与线粒体结构和功能相关的基因。该数据集为研究NASH的发病机制、HCF-1的转录与非转录功能以及NAFLD的缓解提供了重要的遗传工程小鼠模型和数据支持。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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