TOX上调和下调的蕈样肉芽肿细胞RNA测序数据集
该数据集包含通过RNA测序技术获得的基因表达数据,数据模态为转录组测序数据,来源于在Myla细胞系中上调和下调TOX基因的实验组与对照组的比较分析,主要应用于研究TOX基因在皮肤T细胞淋巴瘤(蕈样肉芽肿)发生发展中的转录调控机制,并探索相关基因如PRKAR2B的表达变化,为疾病机制研究和靶点发现提供数据支持。
基本信息
资源简介
该数据集是一个转录组学研究数据集,旨在分析TOX基因在皮肤T细胞淋巴瘤(蕈样肉芽肿)细胞中的调控作用。通过在人源Myla细胞系中分别上调和下调TOX表达(包括过表达组TOX vs G,以及敲低组SH1&SH2 vs SHV),进行RNA测序,以探究TOX相关转录组差异。研究发现TOX的过表达和抑制可导致包括PRKAR2B在内的多个基因的mRNA水平发生变化。数据来源为实验生成的RNA测序数据,主要应用于皮肤T细胞淋巴瘤的分子机制研究、TOX基因功能探索以及潜在治疗靶点识别。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://data.mendeley.com/datasets/b5d3w3hjyj
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个转录组学研究数据集,旨在分析TOX基因在皮肤T细胞淋巴瘤(蕈样肉芽肿)细胞中的调控作用。通过在人源Myla细胞系中分别上调和下调TOX表达(包括过表达组TOX vs G,以及敲低组SH1&SH2 vs SHV),进行RNA测序,以探究TOX相关转录组差异。研究发现TOX的过表达和抑制可导致包括PRKAR2B在内的多个基因的mRNA水平发生变化。数据来源为实验生成的RNA测序数据,主要应用于皮肤T细胞淋巴瘤的分子机制研究、TOX基因功能探索以及潜在治疗靶点识别。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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