TCGA-PCPG嗜铬细胞瘤/副神经节瘤队列
内分泌系统疾病领域多模态公开数据集，来源：gdc.cancer.gov。
基本信息
资源简介
TCGA-PCPG嗜铬细胞瘤/副神经节瘤队列
【一句话概览】
对嗜铬细胞瘤和副神经节瘤（PCC/PGL）的综合分子特征分析显示，这类罕见肿瘤由影响多个基因和通路的多样改变驱动，致病性种系突变见于八个易感基因。研究确定CSDE1为体细胞突变驱动基因，补充了已知的HRAS、RET、EPAS1和NF1四个驱动基因，并发现涉及MAML3、BRAF、NGFR和NF1的融合基因。整合分析将其分为激酶信号、假缺氧、Wnt改变和皮质混合四个分子亚型，MAML3融合基因与转移相关，为精准医疗提供了基础（来源 gdc.cancer.gov）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Comprehensive Molecular Characterization of Pheochromocytoma and Paraganglioma》。
【数据内容】
源站原始描述：We report a comprehensive molecular characterization of pheochromocytomas and paragangliomas (PCCs/PGLs), a rare tumor type. Multi-platform integration revealed that PCCs/PGLs are driven by diverse alterations affecting multiple genes and pathways. Pathogenic germline mutations occurred in eight PCC/PGL susceptibility genes. We identified CSDE1 as a somatically mutated driver gene, complementing four known drivers (HRAS, RET, EPAS1, and NF1). We also discovered fusion genes in PCCs/PGLs, involvi…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：我们报告了对嗜铬细胞瘤和副神经节瘤（PCCs/PGLs）这种罕见肿瘤类型的全面分子特征描述。多平台整合分析揭示，PCCs/PGLs由影响多个基因和通路的多种改变驱动。致病性生殖系突变发生在八个PCC/PGL易感基因中。我们确定了CSDE1作为体细胞突变的驱动基因，补充了四个已知的驱动基因（HRAS、RET、EPAS1和NF1）。我们还发现了PCCs/PGLs中的融合基因，涉及MAML3、BRAF、NGFR和NF1。综合分析将PCCs/PGLs分为四个分子定义的组别：激酶信号亚型、假缺氧亚型、由MAML3和CSDE1驱动的Wnt改变亚型，以及皮质混合亚型。转移性PCCs/PGLs的相关因素包括MAML3融合基因。这种整合的分子特征描述为发展PCC/PGL精准医疗提供了全面的基础。
【主题与分类】
主题标签：Pheochromocytoma、Paraganglioma、TCGA、PCPG、Cancer Genomics、Molecular Characterization、SNP、Copy Number Variation、RNA Expression、miRNA。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面：https://gdc.cancer.gov/about-data/publications/pcpg_2017
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://gdc.cancer.gov/about-data/publications/pcpg_2017
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
TCGA神经内分泌肿瘤相关PCPG多组学队列，包含基因组、表达、甲基化、RPPA和临床数据。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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