47XXY综合表观基因组分析数据集:揭示全基因组DNA高甲基化与活跃染色质可及性

该数据集包含克氏综合征(47XXY)患者的DNA甲基化与染色质可及性表观遗传学数据,数据模态包括通过全基因组亚硫酸氢盐测序(WGBS)生成的甲基化谱和通过ATAC-seq生成的染色质开放状态信息。数据集主要用于研究性染色体非整倍体导致的表观遗传调控异常,特别是全基因组高甲基化及X染色体染色质可及性改变,为理解克氏综合征的早期表观基因组失调机制提供重要资源。

FrontiersFrontiers
frontiersin.figshare.com
2023-06-21 更新
浏览 25
klinefelter syndromeDNA methylationchromosomal accessibilityATAC-seqepigenetics
Table11_Integrative epigenome profiling of 47XXY provides insights into whole genomic DNA hypermethylation and active chromatin accessibility

基本信息

大小
0.008693248 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-21
版本
v1

资源简介

47XXY综合表观基因组分析数据集:揭示全基因组DNA高甲基化与活跃染色质可及性

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Table11_Integrative epigenome profiling of 47XXY provides insights into whole genomic DNA hypermethylation and active chromatin accessibility.XLS》。配套论文《Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of open chromatin, DNA-binding proteins and nucleosome position》发表于 Nature Methods(2013),DOI:10.1038/nmeth.2688。源站首次发布:2023-03-27。

【数据内容】

源站原始描述:Klinefelter syndrome (KS, 47XXY) is a disorder characterized by sex chromosomal aneuploidy, which may lead to changes in epigenetic regulations of gene expression. To define epigenetic architectures in 47XXY, we annotated DNA methylation in euploid males (46XY) and females (46XX), and 47XXY individuals using whole genome bisulfite sequencing (WGBS) and integrated chromatin accessbilty, and detected abnormal hypermethylation in 47XXY. Furthermore, we detected altered chromatin accessibility in 47…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 8.69 MB。数据集 DOI:10.3389/fmolb.2023.1128739.s004。

【主题与分类】

源站学科分类:Biochemistry、Molecular Biology、Enzymes、Protein Trafficking、Proteomics and Intermolecular Interactions (excl. Medical Proteomics)、Receptors and Membrane Biology。主题标签:klinefelter syndrome、DNA methylation、chromosomal accessibility、ATAC-seq、epigenetics。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biochemistry、Molecular Biology、Enzymes、Protein Trafficking、Proteomics and Intermolecular Interactions (excl. Medical Proteomics)、Receptors and Membrane Biology。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table11_Integrative_epigenome_profiling_of_47XXY_provides_insights_into_whole_genomic_DNA_hypermethylation_and_active_chromatin_accessibility_XLS/22338871

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Miao, Nan; Zeng, Zhiwei; Lee, Trevor; Guo, Qiwei; Zheng, Wenwei; Cai, Wenjie; et al. (2023). Table11_Integrative epigenome profiling of 47XXY provides insights into whole genomic DNA hypermethylation and active chromatin accessibility.XLS. Frontiers. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-21,引用时请注意版本时效。

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数据集获取(Figshare)

源站:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table11_Integrative_epigenome_profiling_of_47XXY_provides_insights_into_whole_genomic_DNA_hypermethylation_and_active_chromatin_accessibility_XLS/22338871/1

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数据说明

该数据集是一个针对克氏综合征(Klinefelter syndrome,47XXY)的表观基因组学研究数据集。数据集包含通过全基因组亚硫酸氢盐测序(WGBS)获得的DNA甲基化数据以及通过转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)获得的染色质可及性数据,涵盖了正常男性(46XY)、女性(46XX)和47XXY个体的表观遗传学特征。数据来源于培养的羊水细胞,构建方式为实验测序。该数据集主要用于研究性染色体非整倍体(47XXY)导致的表观遗传调控异常,特别是全基因组DNA高甲基化和X染色体染色质可及性改变,为理解克氏综合征的早期表观基因组失调提供了新的视角。

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