人白色脂肪组织单核分析揭示具有不同代谢特征的脂肪细胞亚群

数据集获取

源站：https://cellxgene.cziscience.com/collections/6b701826-37bb-4356-9792-ff41fc4c3161

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

白色脂肪组织的解剖位置是心脏代谢风险的决定因素。为了理解脂肪库内部/之间的差异，我们从人类皮下或腹腔内脂肪组织（SAT/IAT）中生成了65，668个单核转录组。无监督分析揭示了26个脂肪驻留细胞簇，包括两个成熟脂肪细胞亚群，其特征是脂肪细胞成熟基因高表达与低表达（ADIPOMAThi vs. ADIPOMATlo）。ADIPOMATlo脂肪细胞表现出低分化、促炎和促纤维化的转录组。IAT驻留的ADIPOMATlo在较高BMI供者中更为丰富，而SAT驻留的ADIPOMATlo与血糖受损相关。TSHZ3被确定为ADIPOMATlo转录组的候选调节因子。在脂肪生成祖细胞中敲低TSHZ3可抑制分化，并下调早期脂肪生成调节因子（如CEBPA/B、PPARG）和成熟脂肪细胞基因。小鼠中Tshz3的杂合缺失减少了SAT和IAT重量。

在此，我们展示具有不同转录组特征的人脂肪细胞亚群存在于人类白色脂肪组织中；改变的TSHZ3介导的转录调控可能促成与代谢疾病相关的低成熟亚群。疾病：正常。组织：腹部皮下脂肪组织、腹部内脏脂肪组织。检测方法：10x 3’ v3。单细胞数据集（CZ CELLxGENE）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。