培养的Acomys、Mus、Rattus和Oryctolagus耳廓成纤维细胞的代谢与线粒体图谱（原始数据集）
主题标签：代谢组学、线粒体、成纤维细胞、Seahorse、转录组、糖酵解、氧化应激。本站分类：内分泌、营养和代谢疾病。本数据集为内分泌、营养和代谢疾病领域公开数据集，由Zenodo提供，主题涵盖代谢组学。
基本信息
资源简介
培养的Acomys、Mus、Rattus和Oryctolagus耳廓成纤维细胞的代谢与线粒体图谱（原始数据集）
本数据集为一项多物种成纤维细胞代谢与线粒体特征研究的原始数据集合，英文名称为“Metabolic and mitochondrial profiling of cultured Acomys, Mus, Rattus and Oryctolagus ear pinna fibroblasts (Raw dataset)”。数据来自对四种哺乳动物（Acomys、Mus、Rattus、Oryctolagus）耳廓成纤维细胞的培养实验，围绕代谢与线粒体功能展开多组学与功能学检测。数据集由Zenodo发布，采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可，发布时间为2026年，本站分类归入“内分泌、营养和代谢疾病 / 其他”。该数据集主题涵盖代谢组学、线粒体、成纤维细胞、Seahorse、转录组、糖酵解与氧化应激等方向，适合作为代谢与线粒体研究领域的基础原始数据资源。
【数据集背景】
该数据集来源于一项已发表的科学研究，研究题为“Spiny mouse fibroblasts exhibit a baseline preference for glycolysis and are resilient to oxidative stress across lifespan”，发表于Journal of Biological Chemistry（2026）。研究关注不同哺乳动物物种来源的耳廓成纤维细胞在代谢与线粒体层面的差异，尤其是糖酵解偏好与氧化应激耐受性。数据集即为该研究过程中产生的原始实验数据集合，用于支撑上述研究结论并供后续分析复用。
【数据内容】
数据集包含多个实验模块产生的原始数据，具体涵盖：Seahorse线粒体压力测试与糖酵解压力测试；非靶向与靶向代谢组学数据集；批量转录组分析；线粒体成像数据分析（Mitotracker Red）；以及使用JC-（源站描述在此处截断）进行的线粒体膜电位估计。上述内容覆盖了从功能代谢检测到组学层面的多维度数据，涉及四种哺乳动物耳廓成纤维细胞的培养样本。
【采集与来源】
数据来自对Acomys、Mus、Rattus和Oryctolagus四种哺乳动物耳廓成纤维细胞的培养实验。来源站为doi.org，发布机构为Zenodo。作者包括Aryee, Ebenezer、ALOYSIUS, AJOY、Riddell, Brennan、Liu, Huazhen、Vekaria, Hemendra, J、Seifert, Ashley。发布时间为2026年。源站描述中提供了已发表文章的链接与DOI（https://doi.org/10.1016/j.jbc.2026.113605），但未提供样本采集地点、时间、伦理审批等更详细的采集信息。
【适用场景】
该数据集适用于代谢组学、线粒体功能、成纤维细胞生物学、糖酵解与氧化应激等研究方向。可用于跨物种代谢特征比较、Seahorse功能检测数据的再分析、代谢组与转录组的整合分析，以及线粒体成像与膜电位相关研究。由于涉及内分泌、营养和代谢疾病分类，也可作为该领域方法学验证或对照数据使用的参考资源。
【使用方法】
数据集以原始数据形式发布，使用者可根据各实验模块（Seahorse、代谢组学、转录组、线粒体成像、膜电位估计）分别进行数据处理与分析。使用时应遵循Creative Commons Attribution 4.0 International许可的要求，注明数据来源与作者。源站未提供具体的数据文件格式、目录结构、分析流程或软件参数等使用说明。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、缺失值、批次效应、样本量或技术重复的具体信息。数据集为原始数据，未经过标准化或归一化处理，使用者需自行完成质控与预处理。源站描述中关于JC-的线粒体膜电位估计方法信息不完整，可能影响对该部分数据的直接使用。此外，源站未提供样本伦理信息、物种品系、年龄或性别等元数据，可能限制部分分析场景。
【引用与许可】
使用该数据集时应引用已发表研究：Aryee E, Aloysius A, Saxena S, Donahue R, Riddell B, Vekaria H, Sullivan PG, Liu H, Kachroo P, Seifert AW. Spiny mouse fibroblasts exhibit a baseline preference for glycolysis and are resilient to oxidative stress across lifespan. Journal of Biological Chemistry (2026). DOI: 10.1016/j.jbc.2026.113605。许可协议为Creative Commons Attribution 4.0 International，允许在署名前提下共享与改编。发布机构为Zenodo，来源站为doi.org。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23270260
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 5.9 MB。
数据说明
该仓库包含多项实验的原始数据，这些实验旨在对已发表研究中的不同哺乳动物物种培养的耳廓成纤维细胞进行代谢谱分析：> Aryee E, Aloysius A, Saxena S, Donahue R, Riddell B, Vekaria H, Sullivan PG, Liu H, Kachroo P, Seifert AW. Spiny mouse fibroblasts exhibit a baseline preference for glycolysis and are resilient to oxidative stress across lifespan. Journal of Biological Chemistry (2026). Published article, DOI. 该数据整理自以下实验；-Seahorse（线粒体与糖酵解压力测试）-代谢组学数据集（非靶向和靶向）-批量转录组分析-线粒体成像数据分析（Mitotracker Red）-使用JC-1估计线粒体膜电位-电子传递链方案（估计ETC复合物依赖性O2消耗）
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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