苏格兰与新加坡队列代谢性状的DNA甲基化预测因子

该数据集来自苏格兰与新加坡队列研究,包含六种代谢性状的表观基因组关联研究(EWAS)汇总统计量,基于Generation Scotland队列,采用OSCA和BayesR+两种方法

datashare_ed
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基因组回归EWASEpigeneticsDNA methylationEpigenetic scoresMetabolic traits
DNA methylation-based predictors of metabolic traits in Scottish and Singaporean cohorts

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

苏格兰与新加坡队列代谢性状的DNA甲基化预测因子

该数据集来自苏格兰与新加坡队列研究,包含六种代谢性状的表观基因组关联研究(EWAS)汇总统计量,基于Generation Scotland队列,采用OSCA和BayesR+两种方法。OSCA结果包括DNAm主成分(PC)校正与非PC校正版本。同时提供六种代谢表观遗传评分(EpiScore)的权重,权重由Elnet和BayesR+两种方法生成,每种性状每种方法各两个文件。数据可用于代谢性状的表观遗传预测建模与跨队列验证(来源 datashare.ed.ac.uk)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集对应研究:“DNA methylation-based predictors of metabolic traits in Scottish and Singaporean cohorts”。该数据集内的文件包括在Generation Scotland中针对六种代谢性状的表观基因组关联研究(EWAS)的汇总统计量,使用了两种不同方法:OSCA和BayesR+。对于OSCA文件,包含了DNAm主成分(PC)校正和非PC校正的结果。包含了六种代谢表观遗传评分(EpiScore)的权重。这些权重使用两种方法生成:Elnet和BayesR+。每种性状(及每种方法)的EpiScore权重均已包含(每种性状两个文件)。

【主题与分类】

主题标签:EWAS、Epigenetics、DNA methylation、Epigenetic scores、Metabolic traits。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/8877

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集对应研究:“苏格兰和新加坡队列中基于DNA甲基化的代谢特征预测因子”。本数据集内的文件包括在Generation Scotland中,使用OSCA和BayesR+两种不同方法对六种代谢特征进行全表观基因组关联研究(EWASs)的汇总统计量。对于OSCA文件,包含了经DNAm主成分(PC)调整和未经PC调整的结果。还包括六种代谢表观遗传评分(EpiScores)的权重。这些权重是使用Elnet和BayesR+两种方法生成的。每种特征(及每种方法)的EpiScore权重均包含在内(每种特征两个文件)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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