基于CpG位点相对甲基化排序的脑转移瘤起源识别

该数据集包含胶质瘤、脑转移瘤及七种其他原发性癌症的DNA甲基化谱数据,基于样本内CpG位点的相对甲基化排序(RMOs)方法,旨在准确识别脑转移瘤的起源癌症类型,以辅助临床精准治疗决策,适用于癌症诊断、甲基化生物标志物研究和肿瘤异质性分析。

Guo, Zheng; Chen, Haifeng; Yan, Haidan; Chen, Jianming; Li, Meifeng; Xia, Jie; Chen, Guoping; Wang, Ouxi; Xie, Jiajing; Liu, HuiGuo, Zheng; Chen, Haifeng; Yan, Haidan; Chen, Jianming; Li, Meifeng; Xia, Jie; Chen, Guoping; Wang, Ouxi; Xie, Jiajing; Liu, Hui
Taylor & Francis Group
2024-02-23 更新
浏览 39
Primary cancerBrain metastasesDNA methylationOriginRelative methylation orderings
Identification of the origin of brain metastases based on the relative methylation orderings of CpG sites

基本信息

大小
0.003080065 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-02-23
版本
v2

资源简介

基于CpG位点相对甲基化排序的脑转移瘤起源识别

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Identification of the origin of brain metastases based on the relative methylation orderings of CpG sites》。配套论文《Identification of the origin of brain metastases based on the relative methylation orderings of CpG sites》发表于 Epigenetics(2020),DOI:10.1080/15592294.2020.1827720。项目资助方:This work was supported by the National Natural Science Foundation of China [grant numbers. 61801118] and the Fujian natural science foundation [grant number. 2019J01678].。源站首次发布:2020-10-23。

【数据内容】

源站原始描述:Accurate diagnosis of the origin of brain metastases (BMs) is crucial for tailoring an effective therapy to improve patients’ prognosis. BMs of unknown origin account for approximately 2–14% of patients with BMs. Hence, the aim of this study was to identify the original cancer type of BMs based on their DNA methylation profiles. The DNA methylation profiles of glioma (GM), BM, and seven other types of primary cancers were collected. In comparison with GM, the reversal CpG site pairs were identif…

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个,合计 3.08 MB。kepi_a_1827720_sm6798.xlsx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet,1.20 MB。kepi_a_1827720_sm6797.docx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document,1.88 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.12994179.v2。

【主题与分类】

源站学科分类:Biophysics、Biochemistry、Microbiology、Genetics、Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology。主题标签:Primary cancer、Brain metastases、DNA methylation、Origin、Relative methylation orderings。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biophysics、Biochemistry、Microbiology、Genetics、Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology。

【获取与许可】

源站页面:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Identification_of_the_origin_of_brain_metastases_based_on_the_relative_methylation_orderings_of_CpG_sites/12994179

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Identification of the origin of brain metastases based on the relative methylation orderings of CpG sites. Taylor & Francis. Liu, Hui; Chen, Jianming; Chen, Haifeng; Xia, Jie; Wang, Ouxi; Xie, Jiajing; et al

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-02-23,引用时请注意版本时效。

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源站:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Identification_of_the_origin_of_brain_metastases_based_on_the_relative_methylation_orderings_of_CpG_sites/12994179/2

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数据说明

该数据集旨在通过DNA甲基化谱识别脑转移瘤(BMs)的原始癌症类型,以支持精准治疗。数据集收集了胶质瘤(GM)、脑转移瘤以及七种其他原发性癌症的DNA甲基化数据。研究方法基于样本内CpG位点的相对甲基化排序(RMOs),识别了与胶质瘤相比其他癌症类型中反转的CpG位点对,并利用这些位点对区分胶质瘤、脑转移瘤及其他原发性癌症。实验结果显示,胶质瘤样本全部被正确识别,其他原发性癌症(除乳腺癌外)识别准确率超过93%,而133个脑转移瘤样本中,95%被正确分类至其原始癌症类型。该数据集适用于癌症起源诊断、DNA甲基化生物标志物发现及精准医疗研究。

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