斑马鱼肾上皮细胞转分化与活细胞挤出形成腺体的数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.3hp84t0

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 89.4 KB。

数据说明

转分化是一种人们了解甚少的现象，即终末分化的细胞获得了全新的身份。在此，我们描述了斑马鱼中一个自然发生的转分化的罕见例子，其中肾远端小管上皮细胞被转化为一种称为斯坦尼氏小体（Corpuscles of Stannius, CS）的内分泌腺。我们发现这一过程需要Notch信号传导，并与Hnf1b转录因子的细胞质隔离有关，而Hnf1b是肾小管命运的主调控因子。Irx3b转录因子的缺陷会导致远端小管细胞以Notch依赖的方式异位转分化为CS身份。通过活细胞成像，我们展示了CS细胞集体发生顶端收缩，随后从管状结构中挤出，形成一个独立的器官。这一系统为理解转分化的分子和形态学基础提供了一个宝贵的新模型，并将推动利用这一罕见现象进行治疗的研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。