数据来源：斑马鱼中过氧化物酶体增殖物响应元件亚功能化导致重复fabp1基因保留

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.q03n7

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数据集大小约 870.7 KB。

数据说明

背景：在重复-退化-互补（DDC）模型中，一个重复基因有三种可能的命运：它可能通过突变的积累而失去功能（非功能化），获得新功能（新功能化），或者每个重复基因可能保留祖先基因功能的一个子集（亚功能化）。启动子进化在真核生物基因组中重复基因保留方面所起的作用尚不清楚。脂肪酸结合蛋白（Fabp）属于一个多基因家族，在序列和功能上高度保守，但在基因调控上存在差异，这表明选择压力是通过启动子中的调控元件施加的。先前的一份报告显示，斑马鱼fabp1b.1和fabp1b.2启动子经历了过氧化物酶体增殖物激活受体（PPAR）转录控制的亚功能化。fabp1b.1启动子保留了功能性PPAR应答元件（PPRE），而fabp1b.2则没有。结果：在本研究中，我们描述了斑马鱼fabp1a、fabp1b.1和fabp1b.2启动子相对于祖先fabp1基因的差异性PPAR调控。

通过序列分析评估了启动子的进化，以及PPAR激动剂对斑马鱼肝脏和肠道离体细胞中fabp1启动子活性的差异性激活，以及在瞬时转染野生型和突变型fabp1启动子-报告基因构建体的HEK293细胞中的情况。斑点雀鳝的fabp1，作为祖先fabp1的代表，对PPARα和PPARγ均有响应，并显示出对PPARα激活的双相响应。斑马鱼的fabp1a对PPARα具有选择性，fabp1b.1对PPARγ具有选择性，而fabp1b.2则不受PPAR调控。结论：斑马鱼的fabp1启动子经历了连续两轮的PPAR选择性亚功能化，导致保留了三个斑马鱼fabp1基因，这些基因表现出刺激特异性的调控。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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