数据来源:斑马鱼(Danio rerio)不同生命阶段的谷胱甘肽S-转移酶蛋白表达

该数据集利用靶向蛋白质组学分析斑马鱼早期生命阶段及成体雌雄不同器官的胞质GST蛋白,并建立基于MRM的检测方法,测定特定GST同工酶及类别的相对丰度

DryadDryad
dryad
浏览 18
蛋白质回归biotransformationmultiple reaction monitoringDanio reriotargeted proteomicsGSTMass spectrometry
Data from: Glutathione S-transferase protein expression in different life stages of zebrafish (Danio rerio)

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.897224441 GB
任务类型
回归
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

数据来源:斑马鱼(Danio rerio)不同生命阶段的谷胱甘肽S-转移酶蛋白表达

Data from: Glutathione S-transferase protein expression in different life stages of zebrafish (Danio rerio)

该数据集利用靶向蛋白质组学分析斑马鱼早期生命阶段及成体雌雄不同器官的胞质GST蛋白,并建立基于MRM的检测方法,测定特定GST同工酶及类别的相对丰度。alpha、mu、pi和rho类GST在受精后4小时胚胎中已有表达,多数GST酶在72 hpf出现并随后持续增加;成体GST表达具器官依赖性,多数类别在肝脏最高。结果支持斑马鱼用于化学相关研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2017。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):斑马鱼是生物医学科学和毒理学中广泛使用的动物模型。尽管在转录水平和酶活性水平上已有证据表明斑马鱼存在 I 相和 II 相外源物防御机制,但对外源物代谢酶的蛋白表达知之甚少。鉴于谷胱甘肽 S-转移酶(GSTs)在 II 相生物转化中的重要作用,我们采用靶向蛋白质组学方法,分析了斑马鱼早期生命阶段以及成年雄鱼和雌鱼不同器官中的胞质 GST 蛋白。所建立的基于多反应监测的检测方法,通过结合蛋白特异性肽段和同一类别内共享的肽段,能够测定斑马鱼中特定 GST 同工酶和 GST 类别的相对丰度。alpha、mu、pi 和 rho 类的 GST 早在受精后 4 小时(hpf)即在斑马鱼胚胎中表达。大多数 GST 酶在受精后 72 小时(72 hpf)时已存在,此后其表达持续增加。在成年斑马鱼中,GST 表达具有器官依赖性,大多数 GST 类别在肝脏中表达最高。斑马鱼在早期生命阶段和成年期表达多种胞质 GST 同工酶和类别,这支持将斑马鱼作为模式生物用于化学相关研究。

【主题与分类】

主题标签:biotransformation、multiple reaction monitoring、Danio rerio、targeted proteomics、GST、Mass spectrometry。本站分类:消化系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.5s32v

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5061/dryad.5s32v

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 897.2 MB。

数据说明

斑马鱼是生物医学科学和毒理学中广泛使用的动物模型。尽管在转录水平和酶活性水平上已有证据表明斑马鱼存在 I 相和 II 相外源物防御机制,但对外源物代谢酶的蛋白表达知之甚少。鉴于谷胱甘肽 S-转移酶(GSTs)在 II 相生物转化中的重要作用,我们采用靶向蛋白质组学方法,分析了斑马鱼早期生命阶段以及成年雄鱼和雌鱼不同器官中的胞质 GST 蛋白。所建立的基于多反应监测的检测方法,通过结合蛋白特异性肽段和同一类别内共享的肽段,能够测定斑马鱼中特定 GST 同工酶和 GST 类别的相对丰度。alpha、mu、pi 和 rho 类的 GST 早在受精后 4 小时(hpf)即在斑马鱼胚胎中表达。大多数 GST 酶在受精后 72 小时(72 hpf)时已存在,此后其表达持续增加。在成年斑马鱼中,GST 表达具有器官依赖性,大多数 GST 类别在肝脏中表达最高。斑马鱼在早期生命阶段和成年期表达多种胞质 GST 同工酶和类别,这支持将斑马鱼作为模式生物用于化学相关研究。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案