数据集:胰腺中细胞周期依赖的分化动态平衡生长与内分泌分化

该数据集来自 Dryad,对应 2016 年关于小鼠胰腺发育的研究,包含三维活体成像与体内克隆分析相关数据。研究关注胰腺祖细胞在自我更新与谱系特异性分化之间的平衡,揭示单个细胞对整体行为的贡献,并描述对称自我更新、对称内分泌生成及不对称生成一个祖细胞和一个内分泌祖细胞三种分裂模式

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dryad
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其他分类lineage3-D live imagingcell cyclecell divisionEmbryoHNF1Bexplantprogenitorssystems dynamicsPancreasclonal analysisMathematical model
Data from: Cell cycle-dependent differentiation dynamics balances growth and endocrine differentiation in the pancreas

基本信息

模态
其他
大小
0.000622437 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

数据集:胰腺中细胞周期依赖的分化动态平衡生长与内分泌分化

Data from: Cell cycle-dependent differentiation dynamics balances growth and endocrine differentiation in the pancreas

该数据集来自 Dryad,对应 2016 年关于小鼠胰腺发育的研究,包含三维活体成像与体内克隆分析相关数据。研究关注胰腺祖细胞在自我更新与谱系特异性分化之间的平衡,揭示单个细胞对整体行为的贡献,并描述对称自我更新、对称内分泌生成及不对称生成一个祖细胞和一个内分泌祖细胞三种分裂模式。数据覆盖胚胎期胰腺发育、细胞周期、细胞分裂、HNF1B、SOX9、NEUROG3、外植体及数学模型等主题,可用于研究胰腺内分泌分化、谱系追踪与糖尿病相关机制(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2016。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):器官发生依赖于由不断扩增的祖细胞群驱动的分化与增殖在时空上的平衡。在小鼠胰腺中,群体水平的谱系追踪显示,不断扩增的胰腺祖细胞最初可以产生所有内分泌、导管和腺泡细胞,但到胚胎第13.5天时变为双潜能,产生内分泌细胞和导管细胞。然而,单个祖细胞平衡自我更新与谱系特异性分化的动态从未被描述。利用三维活体成像和体内克隆分析,我们揭示了单个细胞对整体行为的贡献,并展示了三种祖细胞分裂模式:对称更新型、对称内分泌生成型,以及不对称地产生一个祖细胞和一个内分泌祖细胞。定量分析表明,内分泌分化

【主题与分类】

主题标签:lineage、3-D live imaging、cell cycle、cell division、Embryo、HNF1B、explant、progenitors、systems dynamics、Pancreas。本站分类:消化系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.4b58d

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5061/dryad.4b58d

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 622.4 KB。

数据说明

器官发生依赖于由不断扩增的祖细胞池所驱动的分化与增殖在时空上的平衡。在小鼠胰腺中,群体水平的谱系追踪显示,不断扩增的胰腺祖细胞最初能够产生所有内分泌、导管和腺泡细胞,但到胚胎第13.5天时变为双潜能,产生内分泌细胞和导管细胞。然而,单个祖细胞在自我更新与谱系特异性分化之间平衡的动态过程从未被描述。利用三维活体成像和体内克隆分析,我们揭示了单个细胞对整体行为的贡献,并展示了祖细胞分裂的三种模式:对称性自我更新、对称性内分泌生成,以及产生一个祖细胞和一个内分泌祖细胞的不对称分裂。定量分析表明,内分泌分化过程与一个简单的模型相符,即细胞周期依赖的随机启动使祖细胞定向于内分泌命运。这些发现为确定控制参数以优化体外β细胞生成提供了见解。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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