毛囊发育的信号网络

该数据集通过转录组测序技术,提供了14种主要皮肤和毛囊细胞群体的基因表达数据,数据模态为基因表达谱(文本/表格形式),主要应用于研究毛囊发育过程中干细胞、前体细胞与微环境之间的信号网络交互,为揭示毛囊形态发生、再生机制及毛发疾病的病理基础提供全面的分子平台和数据库支持。

Mount Sinai School of MedicineMount Sinai School of Medicine
干细胞与再生医学数据中心
2022-02-20 更新
浏览 39
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Signaling Networks of Developing Hair Follicles

基本信息

许可
openSource
创建/更新时间
2022-02-20

资源简介

毛囊发育的信号网络

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Signaling networks of developing hair follicles》。源站首次发布:2022-02-20。

【数据内容】

源站原始描述:The hair follicle (HF) is a complex miniorgan that serves as an ideal model system to study stem cell (SC) interactions with the niche during growth and regeneration. Dermal papilla (DP) cells are required for activating SCs during the adult hair cycle, but the signal exchange between niche and SC precursors/transit amplifying progenitor cells (TACs) that regulates HF morphogenetic growth is largely unknown. Here we use six transgenic reporters to isolate 14 major skin and HF cell populations. W…

【主题与分类】

主题标签:big data、dermal papilla、epithelial-mesenchymal interactions、hair follicle、hair growth、progenitors、signaling networks、stem cell niche、stem cells、systems biology。

【获取与许可】

源站页面:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=c070c5c4c89852ceff3194a11d90b79a

使用许可:openSource。

规范引用:PMID: 27009580

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集聚焦于毛囊(HF)这一复杂微型器官,作为研究干细胞(SC)在生长和再生过程中与微环境相互作用的理想模型系统。数据集中包含通过六个转基因报告基因分离出的14种主要皮肤和毛囊细胞群体,并利用下一代RNA测序技术对其转录组进行了表征,定义了独特的分子特征。数据来源为实验构建的细胞群体转录组测序结果,主要研究方向包括毛囊形态发生生长过程中的干细胞/前体细胞/微环境信号交换,以及上皮-间质相互作用的信号通路网络分析,为毛囊发育、再生及毛发疾病机制研究提供了全面的交互式在线数据库平台。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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